自从1995年美国的TIGR（The Institute of genomic research ）中心采用全基因组“鸟枪法”（Shotgun）测序策略成功地测定了世界上首个细菌（流感嗜血杆菌）的完整基因组序列后,这种测序方法已被广泛接受,是目前细菌全基因组测序项目中最常用的一种方法.该课题同样采用Shotgun测序策略对表皮葡萄球菌ATCC12228株进行全基因组测序.Shotgun测序过程需要构建小片段（1.5-3kb）和大片段（6-50kb）两个不同的测序文库.该课题的第一部分是测序文库的构建和质量鉴定.该课题的第二部分为大规模测序及全基因组序列的组装.该课题的第三部分采用酶切的方法验证SE12228完整染色体序列组装的正确性,并对此序列进行了初步的分析.