合并产毒艰难梭菌阳性的溃疡性结肠炎患者肠道代谢物和菌群的分析及预测模型建立

来源 :中国人民解放军空军军医大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:HUYA123
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背景:与一般人群相比,溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)患者更容易出现艰难梭菌感染(clostridium difficile infection,CDI)或者艰难梭菌定植(clostridium difficile colonization,CDC)。然而,由于UC疾病活动与CDI的临床症状及化验指标等存在很大的相似性,目前对于合并艰难梭菌阳性的UC患者无法确定其临床症状是否是由CDI导致,这会影响下一步是否行根除艰难梭菌治疗的临床决策。既往多项研究表明,CDI和CDC患者的肠道菌群和代谢物存在差异,但是,关于通过检测肠道菌群和代谢物来区分UC合并CDI(UC complicated with clostridium difficile infection,UC-CDI)和UC合并CDC(UC complicated with clostridium difficile colonization,UC-CDC)还鲜有研究。目的:1、明确UC-CDI和UC-CDC患者的肠道菌群和代谢物特征;2、探索可区分UC-CDI和UC-CDC的标志性细菌和代谢物。方法:1、对临床确诊的UC住院患者进行产毒艰难梭菌检测(Gene Xpert),收集阳性患者的粪便标本,然后根据规范化抗艰难梭菌治疗效果,将患者分为UC-CDI组和UC-CDC组;2、使用非靶向液相色谱-质谱技术对10例UC-CDI和25例UC-CDC患者的粪便样本中的代谢物进行检测,将得到的数据进行多元统计学分析以及单变量统计分析,筛选差异代谢物,探索可能与UC-CDI或UC-CDC相关的代谢物通路;3、利用二代宏基因组技术对10例UC-CDI和25例UC-CDC患者的粪便样本的菌群进行测序,通过主成分分析、聚类分析、相关性分析等对UC-CDI组或UC-CDC组的菌群在基因、物种以及功能水平进行比较;4、利用随机森林算法建立预测模型,并通过ROC曲线下面积来评价筛选出的肠道菌群和代谢物的分类效果。结果:1、UC-CDI组和UC-CDC组患者之间的肠道代谢物有明显差异,其中UC-CDI组与无腹泻UC-CDC组的差异最明显;2、与UC-CDC组相比,在UC-CDI组患者中N-乙酰鸟氨酸、胆酸、泛酸、肌酸等代谢物减少,而多种羧酸衍生物明显富集;3、UC-CDI组和UC-CDC组患者之间的肠道菌群存在差异。坦纳菌科(Tannerellaceae)、螺杆菌科(Helicobacteraceae)、狄氏副拟杆菌(Parabacteroides_distasonis)在UC-CDI中富集,而阿克曼氏菌科(Akkermansiaceae)和疣微菌目(Verrucomicrobiales)在UC-CDC中富集;4、基于肠道细菌和代谢物组合特征集的随机森林分类器在区分UC-CDI组和UC-CDC组时具有强大的诊断性能。结论:1、UC-CDI组和UC-CDC组患者的肠道代谢物和肠道菌群存在差异;2、N-乙酰鸟氨酸以及狄氏副拟杆菌(Parabacteroides_distasonis)等可能为区分UC-CDI和UC-CDC有效生物标志物。
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