POT1蛋白相互作用蛋白的规模化发掘及相互作用网络的初探

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mingxue27
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:以端粒保护蛋白POT1作为诱饵蛋白,大规模发掘它的相互作用蛋白,试图构建以POT1为中心的蛋白质相互作用网络,为肝脏蛋白质相互作用网络的构建进行初步的基础性研究和原始数据积累。 方法:采用酵母双杂交技术,以POT1为一级诱饵筛选相互作用蛋白,以筛选到的猎物蛋白作为二级诱饵蛋白再次进行相互作用蛋白的筛选,再以二级诱饵筛选到的部分具有重要功能的猎物蛋白为三级诱饵蛋白,集中采用高通量酵母双杂交方法大规模筛选成人肝cDNA文库,得到更多相互作用蛋白。采用生物信息学分析方法对所获得数据进行系统的分析,用Osprey软件将结果视化,绘制相互作用关系网络图。 结果:在整个筛选过程中成功构建了多个诱饵蛋白的酵母表达载体进行级联筛选,其中一级诱饵POT1筛选到 5 个新的相互作用蛋白 HSCK2B,LAMC3,SERTAD1,MVP,GEF,以它们为二级诱饵进一步筛选到 TGM2,JAB1,HIVEP1,AGPAT2,CKAP4,HRSP12,CDC5L,RPS6,ATF4,NF-κB1,SHANK3,MCPH1,NR4A1,GSDML20,最后以这20个蛋白为诱饵,利用高通量酵母双杂交系统对成人肝cDNA文库的筛选,共获得236个相互作用蛋白,经过回转验证和生物信息学分析,最终得到107对高可信度的相互作用,基中102对为新发现的相互作用,这些相互作用构成了一个错综复杂的蛋白质相互作用网络。 结论:筛选得到的236对相互作用,其中107对为高可信度相互作用,他们构成了一个关系复杂的蛋白相互作用网络。新发现的这些相互作用对有助于研究单个蛋白的功能和转运机制,并为已知蛋白新功能的认识提供重要的功能线索,该网络为POTl的功能研究提供了新的启示和研究切入点,也为总课题肝脏蛋白质相互作用网络的构建积累了原始数据。
其他文献
目的:高表达的骨桥蛋白(osteopontin,OPN)被认为影响乳腺癌的发生和发展,提示OPN可作为乳腺癌治疗的靶点。本研究是要观察OPN下调对乳腺癌MDA-MB-231细胞生物学行为及基质金属
目的:获取重组人IFN-λ1( rhIFN-λ1)的原核表达产物并测定其效价,研究rhIFN-λ1对兔角膜基质细胞的抗单纯疱疹病毒(Herpes Simplex virus ,HSV)作用。方法:用本实验室构建的
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
重大突发公共事件的处置是一个需各个环节相互配合的系统工作,媒体的应急处理是其中的一个重要环节。在这个环节上,需要媒体利用有限的信息资源和时间迅速寻求合理的传播方案
目的:研究小鼠自身免疫性心肌炎(Autoimmune Myocarditis,AMC)心肌细胞问粘附分子.1的变化及三七总皂甙干预作用. 方法:实验选用72只近交系4-5周龄雄性BALB/C小鼠,随机均分
本研究通过培养、鉴定成体大鼠毛囊神经干细胞后,将bFGF、CNTF、毛囊神经干细胞分别注入大鼠受损视神经中,应用HE、免疫组织化学、基因芯片、实时定量PCR等方法从形态学、蛋
2013国际线路板及电子组装华南展览会(2013 HKPCA&IPC Show)将于2013年12月4 6日在深圳会展中心盛大举行,主题为“汇聚科技智慧,把脉行业发展”。作为华南地区旗舰展会,现场
任有福,山西省晋城市城区人武部政委,上校军衔。中国书法家协会会员,著名书法家石海之弟子,其作品曾入选中国当代书法家作品选,1997,年中国军事博物馆展出其作品并永久收藏,
吉优360是广东省金稻种业有限公司和广东省农科院水稻研究所用自育的恢复系广恢360与吉丰A配组育成的杂交水稻新组合。该组合高抗稻瘟病,于2016年2月通过广东省农作物品种审
本文通过分析档案类博客的特点及其在档案学科建设和实践工作中的优势,探讨了如何实现档案类博客在档案信息传播工作中的作用。 By analyzing the characteristics of archi