大黄鱼(Larimichthys crocea)是中国海水网箱养殖量最大的重要经济物种之一，其生长具有雌雄二态性，然而大黄鱼性腺分化分子机制相关知识仍然匮乏，性腺分化过程中基因表达情况缺乏系统研究。因此，本文对不同发育阶段的大黄鱼雌雄性腺进行分别测序，然后进行比较分析。主要研究结果如下:　　1、取8月龄大黄鱼雌雄性腺进行RNA-Seq，初步考察转录组分析大黄鱼性腺基因表达状况的效率及可靠性。结果显示，RNA-Seq共产生2.5亿个平均125bp的原始读段，经质控、拼接，获得77405个平均长度为896bp的转录本，其中雄性高表达基因13342个，雌性高表达基因3573个，雄性特异表达基因4713个，雌性特异表达基因46个。差异基因的聚类热图显示，雌雄性腺间基因表达模式差异巨大，相同性别样品间重复性好。用该数据库查找了42个性别决定或分化相关基因的序列和表达量，并利用RT-PCR验证了其中12个基因，结果相符的有10个基因，不相符的有2个基因。　　2、取3月龄和18月龄大黄鱼性腺进行RNA-Seq，然后将数据对比到实验室获得的基因组上，结合第一部分研究内容，分析大黄鱼在各个发育阶段性腺表达基因的表达水平，筛选性腺性别特异表达基因。3月龄测序数据注释到21944个基因;8月龄测序数据注释到21924个基因;18月龄测序数据注释到19，659个基因。其中，在大黄鱼3月龄性腺中，有68个基因在精巢中特异性表达，157个基因在卵巢中特异性表达，3910个基因共表达;8月龄时，有1959个基因在精巢中特异性表达，45个基因在卵巢中特异性表达，7480个基因共表达;18月龄时，有976个基因在精巢中特异性表达，140个基因在卵巢中特异性表达，7233个基因共表达;将雌雄数据分别混合，发现仍然有13个基因在精巢中特异性表达，8个基因在卵巢中特异性表达，6773个基因共表达。将大黄鱼雌雄性腺在不同发育阶段中特异表达基因分别作统计分析，更好地观测这些表达基因在每两个相邻时期的变化。　　3、研究对大黄鱼雌雄性腺发育的时序性，获得表达基因在不同发育时期的数量变化。在雄性中，从3月龄到8月龄有2789个基因表达量上升，2944个基因表达量下降;从8月龄到18月龄有2436个基因表达量上升，共有2307个基因表达量下降。在雌性中，从3月龄到8月龄有716个基因表达量上升，5061个基因表达量下降;从8月龄到18月龄有584个基因表达量上升，共有247个基因表达量下降。　　本文为进一步研究大黄鱼的性别分化机制奠定基础，也为鱼类性别分化机制和进化研究提供数据和参考。