小麦地方品种须须三月黄抗白粉病基因Pm61的精细定位

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fujinfa
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小麦白粉病(致病菌Blumeria graminis f.sp.tritici,Bgt)是一种真菌性病害,广泛危害小麦(Triticum aestivum)生产。小麦抗白粉病基因的发掘是提高小麦抗病性的必要条件。地方品种是小麦抗病基因的重要来源。须须三月黄是来自四川丰都的一个抗白粉病地方品种。本研究利用须须三月黄与铭贤169和中作9504分别杂交构建遗传群体,采用比较基因组学和BSR-Seq方法开发多态性分子标记,构建高密度遗传连锁图谱,精细定位须须三月黄的抗白粉病基因。主要研究结果如下:  1、小麦主产区采集的46个测试菌株中,须须三月黄对其中的31个菌株表现抗性。15个测试菌株用于检测和比较Pm61和其它Pm基因的抗谱,与Pm1c的抗性差异最小且仅有4个菌株能够侵染Pm61。其中31个测试菌株用于检测须须三月黄的抗病反应,须须三月黄对20菌株表现出抗性,且对北京、山东和江苏等地的白粉病菌株抗性较好,这表明须须三月黄在一些地区具有利用价值。  2、利用比较基因组学,发现和定位一个新的抗白粉病基因Pm61。须须三月黄×铭贤169和须须三月黄×中作9504的F1、F2和F2∶3群体分别接种白粉菌菌株E09和Bgt1进行抗病性遗传分析,发现须须三月黄的抗病性由一对隐性单基因控制。利用SSR标记分析将其定位于小麦4AL染色体。利用高粱、水稻、粗山羊草、二穗短柄草基因组开展比较基因组分析开发新的EST-SSR标记。须须三月黄的抗白粉病基因位于SSR标记Xicsx65和Xicsx79之间,是一个新的抗白粉病基因座,被正式命名为Pm61。  3、采用BSR-Seq技术加密和丰富Pm61遗传连锁图谱。采用纯合抗病和纯合感病F2∶3家系构建抗感混RNA,利用转录组混池测序(BSR-Seq)的方法,在4AL末端的31Mb区间内富集了80个与抗病性高度相关的候选SNP。在开发的SNP标记中,Xicsn2和Xicsn4与Pm61的遗传距离分别为4.26cM和0.24cM,对应中国春参考基因组物理距离为5.34Mb。  4、利用大群体筛选重组体,构建Pm61的精细定位图谱。以须须三月黄×中作9504构建的5500份F2∶3作图群体为材料,构建Pm61基因的精细定位遗传连锁图谱,进一步将Pm61基因精细定位于SSR标记owm104和KASP标记Xicsk13之间的1.0cM遗传区间内,对应中国春参考基因组上物理区间为693kb。该区间内共注释到47个编码基因,其中包括9个编码抗病相关蛋白的基因。  5、开发分子辅助育种标记。13个KASP标记由BSR-Seq方法产生的多态性SNP标记转化形成,从中筛选了2个多态性KASP标记。利用中国春参考基因组设计964个SSR引物,从中筛选到6个多态性标记。与Pm61紧密连锁的KASP标记Xicsk8和SSR标记owm104可用于Pm61基因的分子标记辅助选择。
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