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增殖放流有效地恢复和增加了渔业资源,改善了生态环境,已经成为世界各国普遍采纳的渔业措施。近年来,长江下游以四大家鱼为主的增殖放流的频次和规模逐渐增加。2016年至2017年,长江下游沿江各地举行了大规模放流活动,增殖放流对渔业资源量的贡献如何、是否对放流物种的遗传资源产生了影响,成为亟待探究的问题。本研究利用11对微卫星标记,对2016年至2017年长江江苏段鲢增殖放流的资源贡献率进行估算,对增殖放流可能造成的潜在遗传风险进行评估,以期为鲢增殖放流工作提供基础数据和参考依据。本研究主要结果如下:1.长江江苏段鲢增殖放流资源贡献率评估2016年至2017年,共采集8个原良种场亲本群体621尾,回捕长江下游4个江段475尾在江鲢个体。通过亲子鉴定技术,在累积排除率99.996%、95%置信水平下,共鉴定出39尾回捕鲢,来自于原良种场亲本繁育的放流子代。通过分析得出,2016年至2017年长江江苏段鲢增殖放流对野生鲢资源的贡献率在8.21%以上。2.长江江苏段鲢增殖放流遗传风险评估(1)遗传多样性11对鲢微卫星标记的多态信息含量范围为0.34~0.938。12个群体中,有8个群体(4个原良种场群体和4个长江鲢群体)在5个以上的基因座中表现出极显著的Hardy-Weinberg不平衡(p<0.001),等位基因分布存在不平衡或差异性明显。所有位点的等位基因数量(Na)的范围为3~33。所有群体中,平均等位基因数量范围为5.727~15.818,平均有效等位基因数(Ne-Allele)范围为4.19~6.526,平均观测杂合度(Ho)范围为0.625~0.727,平均期望杂合度(He)范围为0.69~0.784,平均等位基因丰富度(Ar)范围为16.889~30.161,平均近交系数(Fis)范围为0.026~0.199。平均无偏期望杂合度(UHe)范围为0.718~0.791,表明所有群体的遗传多样性都相对较高。群体间间遗传多样性的大小降序排列为:(1)长江种群中,JJY(靖江段)>ZJY(镇江段)>CSY(常熟段)>ZGY(张家港段)。(2)原良种场群体(即亲本群体),RGH(如皋良种场)>QXH(如皋良种场)>KSH(昆山良种场)>TXH(泰兴良种场)>HTH(皇塘良种场)>WLH(未来良种场)>HJH(邗江原种场)>JRH(句容良种场)。Wilcoxon signed-rank检测结果显示,长江鲢群体的遗传多样性高于原良种场鲢亲本群体,有效等位基因数量高于原良种场群体;长江鲢群体和原良种场鲢亲本群体均面临着近交衰退的风险,而长江鲢群体更严重;两组群体在等位基因丰富度(Ar)上无明显差异。有效群体大小范围自18.6~311.3,长江群体总体上有效群体大小(N_e=301.7)大于原良种场亲本群体(N_e=200.1)。鲢增殖放流对长江江苏段鲢群体的遗传多样性大小(UHe)影响较小,但在遗传风险方面,增殖放流增加了长江鲢群体的近交系数(近交衰退),一定程度上影响了群体的有效群体大小。(2)遗传分化12个群体中,平均遗传分化系数范围为0.003~0.067,3对群体表现出中等的遗传分化(HJH&HTH,0.053;HJH&JRH,0.064;HTH&JRH,0.067),其他群体间均表现出较低的遗传分化系数。群体间基因流(Nm)范围在3.496~79.845之间(Nm>1),群体之间的基因交流很强;长江4个群体之间的基因流远远大于1(Nm>>1)。分子方差分析(AMOVA)显示,所有群体中,有97.03%遗传分化比例归因于种群内分化,只有2.97%遗传分化比例归因于种群间的分化。成对群体的尼氏无偏遗传距离(Nei’unbiased distance)范围为0.002~0.364,成对群体的尼氏无偏遗传相似度(Nei’unbiased identity)范围为0.695~0.998。聚类分析图显示,群体可以分为2组,一组为邗江原种场鲢亲本群体(HJH),另一组为其余11个群体;在不考虑原良种场群体情况下,长江群体中,ZJY(长江镇江段)和CSY(长江常熟段),ZGY(长江张家港段)首先聚集,然后与JJY(长江靖江段)聚集。结果表明,长江下游4个地理群体之间遗传距离没有差异。鲢增殖放流降低了长江江苏段鲢群体的遗传分化系数,增加了群体间基因流,降低了群体间的遗传距离。(3)遗传结构。LnP(D)与ΔK随K值变化的曲线图显示,LnP(D)和ΔK最大时,出现拐点,对应的K值为3,即真实的K值为3。原良种场8个鲢亲本群体和长江下游4个鲢群体,是由3个祖先亚群杂交而来(混合遗传簇)。原良种场鲢亲本群体和长江群体的遗传结构具有一定的差异性,原良种场群体遗传结构中遗传簇Cluster1、遗传簇Cluster 2占比较大,遗传簇Cluster 3占比较小;长江群体遗传结构中,遗传簇Cluster 1占比最大,遗传簇Cluster 2占比较少,遗传簇Cluster 3占比极低。鲢增殖放流影响了长江下游鲢群体的遗传结构,遗传结构呈现单一化趋势。