中棉所70 RIL群体高密度遗传图谱构建及纤维品质QTL定位

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棉花是我国的重要经济作物之一,棉花的纤维品质直接影响棉纺织品质量。随着工业技术的发展和人们生活水平的逐步提高,培育高纤维品质的棉花受到了极大的关注。本研究利用SSR分子标记技术和棉花80K SNP芯片技术,以连续自交的抗虫品种sGK156和优质系非抗虫材料901-001为亲本构建的RIL群体为试验材料,构建高密度遗传连锁图谱,并用WinQTLCart2.5的复合区间作图法定位出与纤维品质相关的QTL,这为分子标记辅助育种奠定了基础。利用RIL群体在2015年和2016年的两年9个环境的纤维品质数据,分析发现各纤维品质性状均呈正态分布,符合品质性状受微效多基因遗传控制的特点。分析各性状间相关性,得出纤维长度与纤维伸长率、纤维强度和整齐度极显著正相关,纤维长度与马克隆值极显著负相关;纤维伸长率与纤维强度和整齐度极显著正相关,纤维伸长率与马克隆值不相关;纤维强度与马克隆值极显著负相关,纤维强度与整齐度极显著正相关;马克隆值与整齐度不相关。本试验选取了从14,280对SSR引物中筛选到的在F2群体中具有多态性的267对SSR引物,进一步筛选131对多态性引物。用这些引物通过SSR分子标记技术检测RIL群体的基因型,获得107个标记位点;再结合棉花80K芯片技术检测RIL群体的基因型,获得的8,306个标记位点。最终整合出标记总数为8,413个,总遗传距离为2,772.79 cM,平均遗传距离为0.33 cM的遗传连锁图,在该图谱中最大的遗传连锁群的遗传标记数为962个,最小的遗传连锁群的遗传标记数为41个。A亚组的总遗传距离为1,269.63 cM,平均遗传距离为0.30 cM;D亚组的总遗传距离1,503.16 cM,平均遗传距离为0.36 cM。基于本试验的9个不同环境的纤维品质性状,采用WinQTLCart2.5复合区间作图(CIM)进行QTL定位,最终得到与纤维品质相关的QTL共300个,其中加性效应为正值的有88个,表明亲本sGK156提高了相关性状的效应值;加性效应为负值的有212个,表明亲本901-001提高了相关性状的效应值。A亚组QTL数目为127个,D亚组QTL数目为173个,表明与纤维品质有关的QTL主要分布在D亚组。在2个及2个以上环境能检测到的QTL有89个,其中与纤维强度相关的QTL有27个,与马克隆值相关的QTL有13个,与纤维长度相关的QTL有16个,与纤维伸长率相关的QTL有26个,与整齐度相关的QTL有7个,这些多环境稳定存在的QTL分布在除了Chr05、Chr07、Chr19、Chr20、Chr23、Chr26以外的其他染色体上。此外,这些QTL还在Chr06、Chr10、Chr12、Chr13、Chr16、Chr17、Chr18、Chr24、Chr25出现了成簇分布现象,这为实现下一步的分子聚合育种,挖掘纤维品质相关的优异基因奠定了重要基础。
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