土壤真菌具有分解有机质、提供营养成分的重要功能，在草地生态系统的物质和能量循环中具有重要的参与功能，因此是草地土壤微生物群落的重要组成部分以及生态系统功能过程的重要调节者。内蒙古温带草原是欧亚大陆草原的重要构成部分，也是中国北方草地的主体，水分是这一地区草原生产力的主要限制因子。本研究沿中国东北样带(NECT)，从东向西（自然降水梯度）选取内蒙古草甸草原、典型草原、荒漠草原作为研究对象，对草原土壤真菌群落组成及其影响因子开展研究，探讨并回答在不同的自然降水梯度中，内蒙古温带草原土壤真菌群落组成是否具有独特的空间分布特征及其影响因素。　　土壤样品采集时间为2012年7月，土壤样品采集的同时进行了植物群落学调查。研究采用高通量454焦磷酸测序分析真菌ITS rRNA多样性，土壤理化测定了气候条件、土壤pH、土壤含水量(SMC)、土壤有机碳(SOC)、土壤全氮(TN)、无机氮含量（NO3--N，NH4+-N）等理化指标。主要结果如下:　　1)三种草原中土壤真菌的组成相同，均由子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、球囊菌门(Glomeromycota)、接合菌门(Zygomycota)、壶菌门(Chytridiomycota)及未知菌(Unidentified)构成，子囊菌门比例最高而球囊菌门比例最低，但各草原中的真菌组成各不相同。三种草原间土壤真菌的香农威纳指数（真菌香农指数）存在显著差异，主要受年均降水量和pH值影响。真菌OTU数目、菌种丰富度指数(chao1)、谱系多样性指数(PD_whole_tree)、真菌香农指数皆在草甸草原中最高。降水梯度的样带上，真菌群落结构主要受硝态氮、土壤含水量和年均降水量影响。　　2)单独分析各个草原类型，草甸草原的真菌香农指数受年均降水量、pH值和地上生物量影响，pH是影响真菌群落组成最主要的生态因子;典型草原的真菌香农指数与硝态氮和植物香农指数负相关;荒漠草原的真菌香农指数与植物香农指数负相关。草甸草原和典型草原的真菌群落结构和年均降水量相关，荒漠草原的真菌群落结构和生态因子没有相关性。　　综上，沿自然降水梯度，不同草原类型中土壤真菌群落组成差异显著，并表现出独特的生物地理空间分布特征。土壤真菌在内蒙古温带草原的分布模式主要由生态因子决定，在降水相对较多的草原，pH和降水量是影响真菌群落在不同草地类型中组成差异的重要因子;在降水较少的草原，真菌群落组成与植物香农指数相关。研究结果为干旱、半干旱草地生态系统的土壤真菌群落分布和影响因子提供了依据，对草原的科学管理和气候变化的应对有着理论指导意义。