农产品流通一头连着农民的“菜园子”,一头连着市民的“菜篮子”,是关系国计民生的大问题。近年来,为改善“卖菜难、买菜贵”、“丰产滞销”等农产品流通现状,政府曾多次出台文件大力支持和鼓励订单农业的发展。订单农业的发展在一定程度上提高了农产品的流通效率,但也因较高的违约率而饱受诟病。因此,农产品供应链协调问题成为农产品供应链管理领域的研究重点。产出和需求具有随机性、农户和公司的风险偏好和谈判能力不同是农产品供应链最为显著的特征。基于此,本文以一个农户和一个公司组成的“农户+公司”型两级农产品供应链为研究对象,结合农产品流通的实际情况构建了农产品供应链的决策模型,重点考察了农产品生产不确定性、市场需求不确定性和农户风险承受能力等因素对农户和公司决策行为的影响。研究表明,不提供任何协调机制时,分散决策下整条农产品供应链的期望收益总小于集中决策下农产品供应链的期望收益,为此,本文采用收益共享契约来协调该供应链,并基于不对称纳什协商模型设定合理的收益共享系数实现了“农户+公司”型两级农产品供应链的完美协调。