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[第一部分]大鼠ⅡA型磷脂酶A2分子进化的研究
目的:研究大鼠ⅡA型磷脂酶A2(PLA2)分子进化的一些特点,了解这一分子结构形成的可能原因,为合成和结构改造提供信息。
方法:收集所有已知的大鼠ⅡA型PLA2的cDNA和基因资料,比较编码区DNA序列和氨基酸序列;分析其碱基取代以及取代发生的位置;取代是同义取代和非同义取代、转换还是颠换;氨基酸取代的性质和位置等特点。
结果:1.大鼠ⅡA型PLA2基因发生碱基取代时,存在在密码子第Ⅱ位多于第Ⅰ位和第Ⅲ位,非同义取代多于同义取代,颠换多于转换现象;2.氨基酸取代多集中于ⅡA型PLA2蛋白分子的后半段(C端);3.部分氨基酸取代发生的氨基酸性质的改变,对其功能可能会产生影响,部分氨基酸取代的性质无改变,可能对其功能影响不大。
结论:1.大鼠ⅡA型PLA2存在加速进化现象,可能是由于协同进化所致;2.大鼠ⅡA型PLA2的分子的基本结构和功能可能N端更为关键;3.部分取代氨基酸的性质改变可能会对其功能产生影响。
[第二部分]不同大鼠IB型磷脂酶A2与ⅡA型磷脂酶A2mRNA的克隆和顺序分析
目的:研究不同大鼠IB型PLA2与IIA型PLA2mRNA碱基取代和氨基酸取代的一些规律,了解ⅡA型PLA2分子进化的特点。
方法:1.取21只大鼠,每只大鼠取胰腺和肺组织各50mg~100mg,用Trizol试剂法提取总RNA,经RT-PCR技术扩增出IB型PLA2(胰腺)与ⅡA型PLA2(肺)的cDNA片段;2.经电泳确认条带清晰的PCR产物,进行DNA测序;3.分别比较21只大鼠间IB型PLA2和ⅡA型PLA2mRNA的测序结果,如二者碱基取代、氨基酸替换及测序图谱,进行DNA方面的分析。
结果:1.在21只大鼠中,ⅡA型PLA2比IB型PLA2有着更多的SNP位点(2∶1),发生了更多次数的碱基取代(9∶2);2.突变的SNP位点图谱中存在杂合和纯合现象;3.11次碱基取代集中于5只大鼠身上。
结论:1.ⅡA型PLA2比IB型PLA2基因进化的速度更快,两种基因的不同进化速度是一种分子水平上的镶嵌进化现象;2.IB型PLA2和ⅡA型PLA2的cDNA可检测到杂合子和纯合子。
[第三部分]不同浓度葡萄糖对大鼠肝脏星状细胞ⅡA型磷脂酶A2mRNA转录的影响及顺序分析
目的:1.了解高糖和普通DMEM培养液对培养的大鼠肝脏星状细胞ⅡA型PLA2mRNA转录的影响;2.大鼠肝脏星状细胞在体外培养时,ⅡA型PLA2是否可增加突变机会。
方法:1.分别用高糖(25mM)和普通(5.55mM)DMEM培养液培养大鼠肝脏星状细胞,以β-actin为参照,用RT-PCR半定量的方法比较二者ⅡA型PLA2表达有无差别;2.传代20代左右,用RT-PCR的方法扩增ⅡA型PLA2的mRNA,测序,与已知的大鼠ⅡA型PLA2基因测序结果比较,观察有无突变。
结果:1.分别用高糖(25mM)和普通(5.55mM)DMEM培养液培养的细胞,ⅡA型PLA2的mRNA的转录水平无明显差别;2.传代后测序结果与已知的大鼠ⅡA型PLA2基因测序结果一致,无突变。
结论:1.不同浓度的葡萄糖对ⅡA型PLA2的mRNA的转录水平无明显影响;2.传代20代后,大鼠肝星状细胞是稳定的。
目的:研究大鼠ⅡA型磷脂酶A2(PLA2)分子进化的一些特点,了解这一分子结构形成的可能原因,为合成和结构改造提供信息。
方法:收集所有已知的大鼠ⅡA型PLA2的cDNA和基因资料,比较编码区DNA序列和氨基酸序列;分析其碱基取代以及取代发生的位置;取代是同义取代和非同义取代、转换还是颠换;氨基酸取代的性质和位置等特点。
结果:1.大鼠ⅡA型PLA2基因发生碱基取代时,存在在密码子第Ⅱ位多于第Ⅰ位和第Ⅲ位,非同义取代多于同义取代,颠换多于转换现象;2.氨基酸取代多集中于ⅡA型PLA2蛋白分子的后半段(C端);3.部分氨基酸取代发生的氨基酸性质的改变,对其功能可能会产生影响,部分氨基酸取代的性质无改变,可能对其功能影响不大。
结论:1.大鼠ⅡA型PLA2存在加速进化现象,可能是由于协同进化所致;2.大鼠ⅡA型PLA2的分子的基本结构和功能可能N端更为关键;3.部分取代氨基酸的性质改变可能会对其功能产生影响。
[第二部分]不同大鼠IB型磷脂酶A2与ⅡA型磷脂酶A2mRNA的克隆和顺序分析
目的:研究不同大鼠IB型PLA2与IIA型PLA2mRNA碱基取代和氨基酸取代的一些规律,了解ⅡA型PLA2分子进化的特点。
方法:1.取21只大鼠,每只大鼠取胰腺和肺组织各50mg~100mg,用Trizol试剂法提取总RNA,经RT-PCR技术扩增出IB型PLA2(胰腺)与ⅡA型PLA2(肺)的cDNA片段;2.经电泳确认条带清晰的PCR产物,进行DNA测序;3.分别比较21只大鼠间IB型PLA2和ⅡA型PLA2mRNA的测序结果,如二者碱基取代、氨基酸替换及测序图谱,进行DNA方面的分析。
结果:1.在21只大鼠中,ⅡA型PLA2比IB型PLA2有着更多的SNP位点(2∶1),发生了更多次数的碱基取代(9∶2);2.突变的SNP位点图谱中存在杂合和纯合现象;3.11次碱基取代集中于5只大鼠身上。
结论:1.ⅡA型PLA2比IB型PLA2基因进化的速度更快,两种基因的不同进化速度是一种分子水平上的镶嵌进化现象;2.IB型PLA2和ⅡA型PLA2的cDNA可检测到杂合子和纯合子。
[第三部分]不同浓度葡萄糖对大鼠肝脏星状细胞ⅡA型磷脂酶A2mRNA转录的影响及顺序分析
目的:1.了解高糖和普通DMEM培养液对培养的大鼠肝脏星状细胞ⅡA型PLA2mRNA转录的影响;2.大鼠肝脏星状细胞在体外培养时,ⅡA型PLA2是否可增加突变机会。
方法:1.分别用高糖(25mM)和普通(5.55mM)DMEM培养液培养大鼠肝脏星状细胞,以β-actin为参照,用RT-PCR半定量的方法比较二者ⅡA型PLA2表达有无差别;2.传代20代左右,用RT-PCR的方法扩增ⅡA型PLA2的mRNA,测序,与已知的大鼠ⅡA型PLA2基因测序结果比较,观察有无突变。
结果:1.分别用高糖(25mM)和普通(5.55mM)DMEM培养液培养的细胞,ⅡA型PLA2的mRNA的转录水平无明显差别;2.传代后测序结果与已知的大鼠ⅡA型PLA2基因测序结果一致,无突变。
结论:1.不同浓度的葡萄糖对ⅡA型PLA2的mRNA的转录水平无明显影响;2.传代20代后,大鼠肝星状细胞是稳定的。