成熟的神经元在形态上高度极化，信号由轴突传到树突。与轴突分化紧密相关的非典型蛋白激酶C(aPKC)，它与PAR3，PAR6蛋白形成复合物，其上游调控机制一直不清楚。在培养的神经元中，发现aPKC直接被Wnt信号胞内下游分子Dishevelled(Dvl)调节。2007年发现，Wnt5a可以激活aPKC并加速轴突分化。Wnt5a促进轴突分化的作用可以被下调Dvl表达和aPKC抑制剂所减弱。因此，Wnt信号通路分子，如Dvl和Wnt5a，通过PAR3/PAR6/aPKC复合物，特别是通过调节aPKC，促进神经元轴突分化。轴突发育涉及细胞骨架的重排，而调节细胞骨架动态的胞外信号尚不清楚。这里，报道Wnt/Ca2+通路对于微丝骨架及生长锥动态的调节。发现当用Wnt5a，这个非经典Wnt信号家族成员，全局或局部处理体外培养的皮层神经元时，均可引起胞内Calpain的激活。Calpain是一个钙依赖的蛋白酶，它可以剪切一些微丝结合蛋白，包括Spectrin。Wnt5a处理可以促进生长锥向前运动及轴突生长，这个作用可以被内钙螯合剂，抑制Calpain活性或下调Calpain的表达，应用防止Spectrin被剪切的竞争性保护肽段所阻止。有趣的是，在新生皮层中，Wnt5a和激活的Calpain都分布于富含轴突的中间区。在体情况下，下调Calpain的表达可以抑制胼胝体区轴突的生长。因此，WntSa，这个生理性的信号，可以通过激活局部的Calpain活性，进而促进生长锥向前运动及轴突生长。