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背景和目的:甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)是甲状腺癌(thyroid carcinoma,TC)中最常见的组织学类型,约占甲状腺癌总数的85%~90%。PTC的发生和发展是多阶段、多步骤的复杂过程,其发病机制目前仍没有完全明确。因此,寻找PTC防治的有效靶点,有助于提高PTC的早诊率及治疗效果。色氨酰-t RNA合成酶(tryptophanyl-t RNA synthetase,WARS)是氨酰-t RNA合成酶(aminoacyl-t RNA synthetase,ARS)家族的重要成员之一,由WARS基因编码,在蛋白质合成、RNA转录和翻译、抗感染、抗血管生成等过程中起着重要作用。同时,WARS在多种肿瘤中呈高表达,调控肿瘤细胞的凋亡、增殖、转移和侵袭,与肿瘤的发生发展及预后密切相关。目前为止,国内外文献中还没有关于WARS在PTC中的表达及其与PTC临床病理学特征的相关性报道,因此,本课题的主要目的是探讨WARS在PTC中的表达及其与临床病理学特征的关系,为PTC的诊治提供实验依据及寻找潜在的治疗靶点。材料和方法:1.基于公共数据平台检测WARS在甲状腺癌中的表达情况,分析WARS的表达与临床病理特征之间的关联。1.1筛选并提取TCGA数据库中甲状腺癌样本的WARS表达数据,收集甲状腺癌样本相应的临床信息,统计分析WARS在甲状腺癌组织及正常甲状腺组织中的差异表达,并进行临床相关性分析及生存分析,为下一步收集样本做免疫组化实验作指引。1.2筛选并提取GEO公共数据库中WARS在PTC样本和正常甲状腺组织表达谱中的数据,统计分析WARS在PTC组织及正常甲状腺组织中的差异表达,进行聚类分析(GO分析)、KEGG富集分析及蛋白质互作网络构建,初步探究WARS在PTC组织中的表达情况及其主要作用机制。2.免疫组织化学染色方法检测WARS在PTC中的表达及其与临床病理学特征的相关性。2.1收集桂林医学院附属医院病理科确诊的170例PTC及配对的170例癌旁甲状腺组织存档石蜡标本,并收集相关临床病理学参数。2.2使用免疫组织化学染色方法检测WARS在PTC组织和癌旁甲状腺组织中的表达情况,用统计软件SPSS分析WARS在甲状腺乳头状癌中的表达以及其与临床病理学特征之间的关系。结果:1.基于公共数据平台分析WARS在甲状腺癌中的表达及与临床病理特征之间的关系。1.1通过分析TCGA数据库中TC样本和非癌甲状腺组织的表达谱数据,结果提示:WARS在TC组织中的表达显著高于非癌甲状腺组织,差异有统计学意义。通过115对TC与癌旁甲状腺组织进行配对分析,结果显示:与非癌组相比,甲状腺癌组WARS表达升高,差异有统计学意义(P<0.05)。1.2本研究提取TCGA数据库中TC样本WARS的基因测序数据,运用R语言探索WARS与临床参数的相关性,结果提示:WARS的表达与PTC患者的淋巴结转移相关(P<0.05),而与患者的年龄、性别、临床分期、TM分期和生存率无明显相关(P>0.05)。1.3 WARS的基因集富集分析(GSEA)结果提示:WARS基因的高表达可通过促进自身免疫性甲状腺疾病、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、胰腺癌、癌症相关通路及小细胞肺癌等信号通路影响甲状腺癌的发生发展;WARS基因的高表达同样可通过抑制甘油磷脂代谢、甘油酯代谢、丁酸代谢、β-丙氨酸代谢、糖基磷脂酰肌醇-锚生物合成等过程影响甲状腺癌的发生和进展。1.4 GEO数据库分析结果显示:WARS在PTC组织中的表达显著高于正常甲状腺组织,差异有统计学意义(P<0.05)。1.5 GO分析表明,WARS通过细胞外基质组织、细胞外结构组织、生殖系统发育、细胞基质粘附、骨化、细胞间连接组装、跨膜受体蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶信号通路、黑素细胞分化、色素细胞分化等生物学过程参与PTC的调控;在调节细胞成分方面,WARS在含胶原的细胞外基质、内质网腔、顶端质膜中参与PTC的调控。此外,WARS的功能主要在细胞外基质结构成分、糖胺聚糖结合及胶原结合过程中被影响。KEGG富集分析结果提示WARS可在细胞外基质-受体相互作用、粘着斑、硫代谢、补体和凝血级联、细胞凋亡、蛋白质消化吸收等信号通路参与甲状腺乳头状癌的调控。蛋白质互作网络构建结果显示:热休克蛋白-5、磷酸核糖甘氨酰胺转甲酰酶和过氧化物酶体增殖体激活受体γ均与WARS联系紧密,互作评分均大于0.4。2.免疫组织化学染色方法检测WARS在甲状腺乳头状癌中的表达探讨其表达与临床病理学特征的相关性。2.1 WARS在PTC组织中高表达,在癌旁甲状腺组织中低表达,差异具有统计学意义(P<0.05)。2.2 WARS在PTC组织中的表达与肿瘤大小、淋巴结转移相关,且差异具有统计学意义(P<0.05)。2.3 WARS在PTC组织中的表达与患者年龄、性别、发生部位(单侧、双侧)、肿瘤数量、有无被膜侵犯及临床分期均无相关性(P>0.05)。结论:WARS在PTC中表达上调,可能参与了PTC的发生与进展;WARS在PTC组织中的高表达可能促进了肿瘤生长和淋巴结转移。