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对贵州省松桃县水洞、下洞、千洞、连家洞、凉风洞5个喀斯特洞穴各光带分三个水期（平水期、丰水期和枯水期）进行底栖动物的调查研究,运用冗余分析（RDA）研究了底栖动物群落结构与环境因子的关系并运用了美国环境保护署（US EPA）推荐的健康风险评价模型对水体重金属进行了健康风险评价。旨在了解研究区洞穴底栖动物的群落结构特征和影响洞穴底栖动物群落结构的主要环境因子以及洞穴水体的重金属健康风险,为洞穴底栖动物多样性保护及洞穴资源的开发利用提供科学依据和理论指导,为洞穴水域生态系统的物质循环和能量流动提供基础数据和背景资料。研究结果如下:（1）三个水期5个洞穴共采集3218号标本,93种（或类群）,隶属4门7纲16目60科82属,软体动物与水生昆虫是主要类群,物种的季节性变化是丰水期（56）>平水期（53）>枯水期（51）。平水期5个洞穴共有23种优势种,丰水期5个洞穴共有为18种优势种,枯水期5个洞穴共有20种优势种。三个水期5个洞穴的底栖动物密度、生物量平均值分别为10.5688ind./m2、1.3112g/m2,底栖动物密度平均值与生物量平均值在时间上的变化为:丰水期>平水期>枯水期。（2）Shannon-Wiener多样性指数、Margalef丰富度指数、Pielou均匀度指数、优势度的最高值均出现在平水期,分别为2.3579、3.9136、0.961、1.1294。单因素分析得出:枯水期与平水期、丰水期的底栖动物Margalef丰富度指数测呈显著差异。（3）冗余分析（RDA）得出,不同季节的底栖动物群落结构对环境因子适应性差异明显,研究结果表明,丰水期,底栖动物物种个体数量、物种数、明显随着空气湿度、空气温度的增大而增加,丰富度、多样性指数与洞穴空气中O2和CO2含量及空气湿度呈正相关,优势度、均匀度与溶解氧、水温、水体压强、有机质含量呈正相关。平水期,pH、水温、浊度10、浊度100、洞穴空气中O2含量、溶解氧、空气温度与优势度及底栖动物密度呈正相关,丰富度、多样性指数、均匀度、物种种数、生物量明显与叶绿素a、洞穴空气中CO2含量、流速、沉积物有机质含量、总氮呈正比。枯水期,流速、叶绿素a、洞穴空气中CO2含量、总磷与底栖动物的密度、生物量、物种个体数及物种数呈正比。（4）冗余分析（RDA）得出,不同种类的重金属因子明显对不同底栖动物群落结构存在影响,丰水期,物种个体数、底栖动物密度与Cd、Pb、Cr、Ni呈正相关,与Mn、Cu呈负相关关系;平水期,物种数、多样性指数、丰富度、物种个体数、匀均度、底栖动物生物量与As、Pb呈正相关,底栖动物密度、优势度与Zn、Hg呈正相关;枯水期,物种个体数、物种数、优势度均与As、Ni、Cd、Pb、Cr、Zn呈正相关。（5）三个水期5个洞穴水体重金属洞穴含量低于洞外地表水和地下水,均未超过《地下水质量标准》（GB/T14848-2017）III类水标准。重金属Cd、Pb、Zn在枯水期、丰水期、平水期具有显著差异。Spearman相关性分析表明,Zn和Cd、Pb、Ni、As、Cu可能经过相似的环境地球化学作用。（6）健康风险评价表明,各洞穴平水期总致癌风险大于丰水和枯水期。Cr和As对总健康风险的平均贡献率均在96%以上,Cr和As应作为优先控制管理的污染物。