论文部分内容阅读
有关热激蛋白的研究丰要集中于动物和疾病,而关于其在植物逆境胁迫的研究较少。植物热激蛋白(Heat Shock Proteins,HSPs)是一类重要的胁迫诱导蛋白,不仪受高温胁迫,且受干旱、高盐、高寒、重金属、化学物质、激素等多种逆境诱导,其一旦产生,植物的抗逆性将大大增强。本研究以极度耐热和抗干旱材料齿肋赤藓为研究对象,基于其转录组信息,对热激蛋白70家族和40家族进行生物信息学分析,同时对热激蛋白70家族进行表达模式分析,并克隆热激蛋白基因。结果表明:(1)用SOAP软件对转录组信息进行了拼接,本地BLAST后,经PFAM和SMART数据库预测鉴定获得11条HSP70序列和56条HSP40序列;(2)结合Genbank中公布的其他物种HSP70序列,利用MEGA5.0软件构建HSP70系统进化树,有8条HSP70序列成功构树;(3)用MEME/MAST软件体系做motif分析,发现70家族基因和40家族基因表现出高度保守性;(4) HSP40家族基因的Ka/Ks分析,结果表明unigene6676,unigene13088,unigene25432和unigene24085处于中性进化状态,其他各unigene处于正达尔文选择状态。(5)用半定量方法分析70家族基因的表达模式,结果发现在干旱和热处理下,各序列的响应差异很大,且同一序列对不同处理的响应也存在显著差异;(6)通过电子克隆获得1个完整热激蛋白60基因序列,通过RACE技术克隆了3个热激蛋白70基因,其长度分别达到2366bp,2392bp和2026bp。