传染性造血器官坏死病病毒-SX1704毒株的序列分析及GiCK细胞系的建立

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:carjitar
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
传染性造血器官坏死病病毒(Infectious hematopoietic necrosis virus,IHNV)是一种单股负链RNA病毒,可以水平、垂直感染虹鳟、硬头鳟等冷水鱼类,引起的高致病性和高死亡率给我国鲑鳟养殖业带来了巨大经济损失。IHNV隶属于弹状病毒科(Rhabdoviruses)粒弹状病毒属(Novirhabdovirus)。自1985年中国辽宁省发现第一例IHNV病毒以来,有关IHNV的疫情在中国北京、河北、山东、甘肃、四川、吉林、新疆等地相继报道。多地IHNV病毒感染的检出表明该病毒已成为危害优良鲑鳟种苗的重大隐患。通过对IHNV中国株进行鉴定、分析,进一步明确国内IHNV的分布和遗传进化特征,对于IHNV的安全防治和风险管控具有深远的意义。本实验从中国陕西省宁陕县某渔场采集患病虹鳟,鉴定病样为IHNV阳性。通过在GenBank中查找IHNV序列并设计扩增引物,采用RT-PCR的方法扩增获得部分基因片段。将扩增得到的序列克隆到载体pTriEx-1.1或T载体上构建重组质粒,并进行测序分析。采用步进法扩增,成功克隆到IHNV的六个基因:N、P、M、G、NV、L,以及基因之间的非编码区。将虹鳟病鱼中鉴定的IHNV毒株命名为SX1704,并将序列提交至GenBank获得登录号:MH629974。IHNV-SX1704毒株全长10802bp,从3’到5’依次编码:核衣壳蛋白-聚合酶相关磷酸蛋白-基质蛋白-表面糖蛋白-非结构蛋白-病毒聚合酶蛋白。将毒株SX1704与GenBank其他IHNV序列进行同源性比对,发现与IHNV中国株CH20101008(登录号:KJ421216),HLJ-09(登录号:JX649101)有很高的核酸同源性,相似性百分比达99.3%。CH20101008作为参考毒株,IHNV-SX1704与其相比有78个核苷酸突变,其中24个导致编码氨基酸突变。对SX1704的全序列和六个基因分别构建生物进化树。系统发育进化结果显示,除中国株外,IHNV-SX1704毒株与韩国株、日本株有较近的亲缘关系,基于G基因分型表明SX1704属于J基因型的J Nagano亚型。IHNV的G蛋白是病毒的囊膜蛋白,是病毒用于识别宿主的结构蛋白,也是疫苗设计的主要靶标。本论文的研究中,将IHNV-G基因克隆到膜蛋白表达载体pQBD上,获得了重组质粒pQBD-G。将重组质粒与线性化的杆粒qBac-III共转染sf9细胞培养得到重组杆状病毒rAcMNPV-G。Western blot检测表明G蛋白在重组杆状病毒中成功表达,为今后重组病毒疫苗的免疫效果检测打下了基础。本实验还建立了一株异育银鲫肾细胞系并命名为GiCK。通过用线粒体16s核糖体RNA鉴定新制备细胞系的种属来源,证实其来自于异育银鲫。经PCR检测证明CyHV-2在GiCK细胞上连续传代不超过三代。将构建的重组病毒rAcMNPV-GFP转导GiCK细胞证实重组病毒能进入异育银鲫细胞。因此,GiCK细胞能否作为CyHV-2体外连续增殖的高敏感性细胞系仍值得讨论。细胞系的建立对将来关于CyHV-2病毒感染及其引起疱疹病毒性造血器官坏死病的发病机制的深入研究可能发挥重要作用。
其他文献
目的:肺癌是全世界最常见的恶性肿瘤之一,非小细胞肺癌占肺癌总发病率的85%,这其中大约50%为肺腺癌。由于肺腺癌病因尚不明确,且早期缺少明显的临床症状,易被忽略,而治疗方法仍然是以外科手术切除为主,辅以放疗和化疗。由此可见,对肺腺癌发生发展的分子机制的研究,以及寻找合适的基因靶点对肺腺癌的早期诊断和后期治疗有着重要意义。近几年的研究报道结果显示PRDM5因启动子区CpG岛高甲基化导致其在多种癌症中
硒元素是人类生命活动必需的微量元素之一,摄入过高或过低均会对人体健康造成危害。邯邢地区是河北省重要的粮食产地,同时硒含量相对较高,因此对其进行土壤硒成因及开发利用研究,对合理开发利用富硒土壤资源,保护人体健康,提高当地经济水平、推动传统农业转型具有重要意义。本课题通过对研究区多介质,土壤、地下水、大气降尘及农作物样品的采集及测试,分析确定邯邢地区硒含量水平,通过Arcgis圈定富硒土壤范围并探讨富
玉米炭疽菌(Colletotrichum graminicola)是半活体营养类型植物病原真菌,在不同营养阶段利用不同的致病策略造成病害。铁离子除了作为重要的营养元素和酶辅因子外,还参与调控
空气源热泵在我国清洁供暖中得到了广泛应用,但常规空气源热泵在冬季供暖时,往往会引起强烈的吹风感和干眼问题,如何提高热泵系统供暖热舒适性受到越来越多的关注。空气源热泵墙面板供暖系统具有良好的热舒适性,本文在课题组前期研究的基础上,进一步展开系统性能优化方面的实验研究。设计制作墙面板,结合变频技术搭建空气源热泵墙面板供暖系统实验台,依据实际情况选择数据测量与采集装置,并计算实验台测量误差。对空气源热泵
合成孔径雷达(SAR)是一种具有全天候、全天时和远距离成像的特点的高分辨率成像雷达,对军用和民用具有重要的应用价值。目前根据国内外学者的研究与预测,SAR成像在地形测绘、考古学、沙层、森林覆盖和侦察监视等其他方面也将会有广阔的应用前景。因此对于SAR数据而言,研究成像算法进行成像处理是关键步骤,而且成像之后提高SAR图像的质量也具有重要的研究意义。传统的SAR成像算法大多不适用于大斜视成像模式,而
教师反馈是英语写作教学中的一个关键环节,是提高学生英语写作水平的有效途径。许多研究比较了元语言反馈和直接反馈、间接反馈或其他不同方式写作反馈的效果,其中大部分的研
Proglucagon(PG)是胰高血糖素原基因,其编码产物有胰高血糖素(Glucagon),胰高血糖素样肽-1(GLP-1),胰高血糖素样肽-2(GLP-2)。GLP-1是一种主要由胃肠道系统分泌的肠促胰岛素,
研究目的黑色素瘤是致死率最高的皮肤肿瘤。黑色素瘤是一种可以预防的恶性肿瘤,但是其发病率仍在逐年上升,现已成为我国癌症发病率增长最快的肿瘤之一。肿瘤血管生成拟态(vasculogenic mimicry,VM)是一种区别于传统的肿瘤血管微循环模式,其管壁由肿瘤细胞构成,对传统的抗血管治疗反应不佳。非肿瘤细胞因素的肿瘤微环境对肿瘤进展的影响不容忽视,各种免疫细胞和细胞因子是其重要的组成部分。白细胞介素
汉字是表意体系的文字,对于非汉字文化圈的尼泊尔学生来说,学习汉字是十分困难的,学生在书写汉字时会出现许多的偏误。通过对尼泊尔学生的书写语料的分析研究发现,学生汉字书写偏误主要体现在四个方面:笔画偏误、部件偏误、结构偏误和综合偏误。其中笔画偏误包括笔画增损、误断误连、笔画交接和笔画变形;部件偏误包括部件缺失、部件替换和部件错写;结构偏误包括结构的形式错乱、结构过于分散和结构比例失调;综合偏误主要指一
氧钒配合物是非常重要的一类高价过渡金属配合物,具有抗肿瘤、抗细菌、抗真菌、抗病毒、抗寄生虫、催化剂、降低高脂血症和高血压以及胰岛素增强作用等多种生物活性。近年来的研究表明,氧钒配合物作用于肿瘤细胞的IC50(μM范围)低,而且具有促细胞凋亡和抗增殖作用。因此,深入研究此类配合物的抗肿瘤特性及其机制具有重要的意义,其研究结果可为进一步的临床应用提供重要的实验基础。在该类化合物的抗肿瘤作用机制方面,虽