菠菜SoGCH1与SoPTAR基因上游调控因子筛选及鉴定

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菠菜(Spinacia oleracea L.)是一种重要的世界性绿叶蔬菜,生育期短,叶酸含量丰富,研究菠菜叶酸积累调控规律,对选育高叶酸菠菜品种具有重要意义。已知GTP环化水解酶Ⅰ(GCH1)和蝶呤醛还原酶(PTAR)在植物叶酸积累中发挥重要作用。前者催化植物叶酸底物蝶呤生物合成的第一步反应,是叶酸合成途径中的限速酶。后者作为叶酸降解回补途径的关键酶,能将叶酸降解产物DHPA催化为叶酸前体物质HMDHP。本文拟在前期对叶酸积累途径关键基因SoGCH1和SoPTAR的研究基础上,构建包含其启动子片段的酵母诱饵菌株,进行上游调控因子的筛选及验证,为深入揭示菠菜叶酸积累调控机制奠定基础。主要研究结果如下:1.首先克隆SoGCH1和SoPTAR基因ATG上游2000 bp启动子序列,预测结果表明So GCHI基因核心启动子区域在-1177~-1227 bp之间,其顺式作用元件包含生长素、脱落酸、水杨酸和茉莉酸等激素、光照和逆境胁迫响应元件;SoPTAR核心启动子区域在-720~-770 bp之间,其基因启动子包含生长素、脱落酸和水杨酸等激素、光照及逆境胁迫响应元件。2.根据顺式作用元件分布情况,将SoGCH1启动子(p SoGCH1)和SoPTAR启动子(p SoPTAR)分别分为3个和2个片段,构建诱饵载体p Bait-Ab Ai并转化酵母,获得5个诱饵酵母菌株p G1-Ab Ai、p G2-Ab Ai、p G3-Ab Ai、p P1-Ab Ai和p P2-Ab Ai。通过酵母单杂交试验,初步筛选到能与p SoGCH1和p SoPTAR结合的蛋白数目分别为115和252。排除重复序列后为75和149个,主要包括AHL、HMG、b HLH、SWIB、HD-ZIP、B3-Domain、ZF-HD、AP2、BES、WD40以及ARP等基因家族蛋白。从中挑选出现次数多的17个基因回转进诱饵菌株再次验证,结果显示共10个结合蛋白为阳性候选调控因子,其中So ATHB12和So ZFHD8能与p SoGCH1结合,Sob HLH3、Sob HLH16/PIF7、Sob HLH62、Sob HLH137、So ERF104、So BZR1、So AHL10和So HMGA能与p SoPTAR结合。3.双荧光素酶报告试验结果显示,So AHL10、So HMGA及Sob HLH16参与SoPTAR基因转录水平的调控,So AHL10、So HMGA促进SoPTAR基因表达,而Sob HLH16则抑制p SoPTAR其转录活性;So ATHB12和So ZFHD8对p SoGCH1活性未见明显调控。转录因子结合位点预测结果显示,So AHL10的结合位点A/T序列位于SoPTAR基因上游结合序列-183、-1069、-1107、-1414和-1587 bp处;Sob HLH16结合位点G-Box位于-276、-783、-792、-1107和-1671 bp处;4.叶片So AHL10、So HMGA及SoPTAR的基因表达水平受冠层位置影响,三者表达水平均在功能叶中较高,在老叶和新叶中降低,呈现协同表达趋势,且表达谱与叶片叶酸含量变化规律相似。5.对SoPTAR两个正向调控因子So AHL10、So HMGA进行基因家族分析,结果发现,菠菜基因组包含18个AHL成员,主要定位于细胞核与细胞质中;So AHL家族分为AHL-A/TypeⅠ(9个)和AHL-B(9个)两亚族,其中AHL10位于B亚族。A亚族基因(除So AHL4)不含UTR及内含子不同,B亚族基因含有4~5个内含子。So AHL10启动子较其它B亚族成员启动子含有较多光、ABA及SA响应元件,可能参与光及激素响应的叶酸合成调控。So HMGA是菠菜15个HMG成员一员,为菠菜HMGA亚族唯一成员,无内含子,含有H15结构域和3个AT-hook基序,其启动子上游含有较少光响应元件、激素(JA、ABA和SA)及非生物胁迫(缺氧和低温)响应元件。
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