2021年中国国内并购市场活跃度达到自2018年以来的最高水平,在加快构建国际国内双循环、深入实施国企改革三年行动等新格局下,企业并购迎来新发展机遇并将继续保持整体强劲态势。在国资主导的企业并购时代浪潮,科学合理的对目标企业进行价值评估不仅可以为并购价格提供参考,也可以控制并购风险,实现国有资产保值增值。因此,本文基于并购方视角,通过挖掘企业并购价值,对目标企业的价值进行科学评估,为并购决策提供可靠依据。同时以拟并购实际案例展开研究,在我国并购市场亮点不断涌现的阶段,也具有实践指导意义和参考价值。本文以目标企业价值为研究对象,综合运用当前企业价值评估的理论和方法对其进行合理性评估研究,以期探索企业并购中目标企业价值全面科学的评估。首先对企业并购价值评估的国内外相关文献梳理发现,学术界对企业并购价值的构成并没有统一的界定,且传统的评估模型忽略了非财务因素对企业内在价值的影响,本文以此为切入点展开深入研究。其次简要地概述企业并购和企业价值评估相关概念和理论,在此基础上剖析了企业并购价值构成和目标企业价值评估的影响因素,并比较分析当前企业价值评估的四种主要方法的优缺点及在企业并购中的适用范围。然后选用C公司拟并购M公司的实际案例进行评估实务研究,结合企业并购价值创造理论对并购动机和并购状况进行具体分析,得出目标企业M公司的整体价值应当包括内在价值、协同价值、潜在机会价值（期权价值）。根据不同价值的特性,选用引入管理有效性、产品竞争力、科研创新等非财务指标改进的企业自由现金流（FCFF）模型评估目标企业M公司的内在价值;运用B-S期权定价模型分别评估此次并购将带来的协同价值和期权价值,进而将三项价值加和得到目标企业M公司的整体价值。最后是对评估过程总结以及未来并购下企业价值评估研究趋势的展望。本文研究发现,引入非财务指标改进的企业自由现金流（FCFF）模型在企业并购中有着较强的适用性,基于层次分析法构建财务指标和非财务指标的综合评估体系,可以更好评估目标企业内在价值。此外,并购带来的协同效应具有很强的不确定,而实物期权法与环保高新技术企业特性有着很高的契合度,B-S期权模型能有效评估目标企业的协同价值。评估时考虑并购产生的潜在投资机会价值（期权价值）,可以更真实反映目标企业的整体价值。