中药产业作为吉林省的支柱产业,在全国中药产业拥有较强的竞争优势,对全省经济的带动作用日益突出,已成为吉林省经济新的增长点。而随着加入世贸后知识产权保护的制约和国内外企业的激烈竞争,及中央“振兴东北老工业基地”的提出,吉林省中药产业集群发展显得尤为重要。产业集群对地方经济的发展起到了巨大的推动作用,而创新则是保证这一强大的经济引擎不断运行的动力。吉林省中药产业只有利用产业集群的发展优势,持续推动产业集群创新,才能不断提高中药产业的竞争能力。在此背景下,本文通过对中药产业集群发展及创新基本理论的阐述,尝试建立我国中药产业集群创新能力评价指标体系,采用定量分析的方法——因子分析,对吉林省中药产业集群创新能力进行了横向比较研究和纵向比较研究,并提出了一套理论与现实相结合的对策建议:进一步完善“产学研”合作机制,在积极的政府政策的扶持下,推进人才战略,培育区域文化,从而以产业集群的模式发展我国的高技术产业,推动国民经济的快速发展。期望这些研究成果,对于吉林省中药产业发展具有一定的借鉴意义。