血清游离环状RNAs检测对早期鼻咽癌诊断价值的研究

来源 :广西中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wanglei15950225270
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目的:鼻咽癌的早期诊断对于预后至关重要,目前有研究报道circRNA可以作为癌症的生物标志物,且有不少研究报道了 circRNA对于鼻咽癌发生发展机制的研究。然而,在鼻咽癌患者血清中是否存在特异性的表达谱,其特异表达的circRNA对于鼻咽癌的诊断价值如何,及其对鼻咽癌进展的机制均不清楚。本研究旨在探究早期鼻咽癌患者血清中是否存在特异性的表达谱,其次探究差异表达的circRNA对鼻咽癌的诊断效能,探究其参与鼻咽癌发生发展的作用机制,为鼻咽癌的发病机制寻找突破口。方法:1.采用circRNA芯片技术检测16例血清标本中circRNA的表达谱,并进一步分析其在鼻咽癌中特异性表达,挑选出其中上调及下调表达各前五的circRNA,利用qRT-PCR技术在16例标本中进行验证,验证芯片结果的可靠性。2.同样利用qRT-PCR技术检测候选出的circRNA在另外的鼻咽癌患者、鼻炎鼻息肉患者及健康对照者血清中的表达情况,评价其对于早期鼻咽癌诊断价值。3.利用生物信息学技术分析差异表达的circRNAs的亲本基因在鼻咽癌发生发展机制中的可能发挥的作用,同时结合TargetScan和miRanda数据库对在血清中上调及下调前十的circRNA预测其可能结合的 miRNA 及 mRNA。结果:1.通过circRNA芯片技术发现在早期鼻咽癌患者血清中存在差异表达的circRNAs,不仅存在显著上调的177个circRNA,同时还存在显著下调的179个circRNA,这提示circRNA在鼻咽癌发生发展中存在多种尚未明确的功能。通过筛选,我们得到了在早期鼻咽癌中具有差异表达的候选的三个circ RNA,利用q RT-PCR技术进行验证,同时验证产物序列,表明候选的circ RNA在早期鼻咽癌血清中确实存在差异表达。2.与健康对照相比,鼻咽癌患者hsa_circ_0006220表达明显上调,血清hsa_circ_0006220对早期NPC的曲线下面积为0.8260(95%CI为0.6922~0.9598);与鼻炎鼻息肉组相比,鼻咽癌患者hsa_circ_0006220表达同样明显上调,血清hsa_circ_0006220对早期NPC的曲线下面积为0.7917(95%CI为0.6461~0.9373)。同样的候选circRNAs hsa_circ_0001666,与健康对照相比,鼻咽癌患者hsa_circ_0001666表达明显上调,血清hsa_circ_0001666对早期NPC的曲线下面积为0.8933(95%CI为0.9135~1.000);与鼻炎鼻息肉组相比,鼻咽癌患者hsa_circ_0001666表达同样明显上调,血清hsa_circ_0001666对早期NPC的曲线下面积为0.8200(95%CI为0.6797~0.9603)。hsa_circ_0006220及hsa_circ_0001666对早期NPC具有较好的诊断价值,两者联合诊断优于单一的circRNA,且本研究的重要发现揭示了外周血游离的circRNAs对NPC诊断作用,将有利于发现具有临床应用潜能的NPC新的分子诊断标志物。3.利用生物信息学技术我们重点分析了在血清中差异表达的circRNAs亲本基因在鼻咽癌发生发展中的潜在作用,并预测了能结合的5个miRNA及其下游的m RNA。结论:在早期鼻咽癌患者血清中存在特异性circRNAs表达谱,从早期鼻咽癌患者血清中差异表达的circRNAs表达谱中挑选出的两个上调的circRNAs对其具有中等诊断价值,联合检测具有较高诊断价值;而在早期鼻咽癌血清中上调及下调的circRNAs均参与鼻咽癌的发生发展,特别是黏着斑信号通路,我们认为circRNAs对于鼻咽癌不仅有诊断价值,同时可能在鼻咽癌发生发展中发挥癌基因作用。
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