缺血性心肌病中铁死亡相关基因的生物信息学分析与验证

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pengguanxin
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:缺血性心肌病(Ischemic cardiomyopathy,ICM)是一种由心脏氧供应和需求的持续失衡引起的疾病,随着疾病的进展心肌细胞逐渐丧失,并最终导致心肌瘢痕化和心室衰竭。ICM的病理生理机制包括一系列代谢、神经体液和炎症改变,例如心肌细胞肥大、纤维化、炎症、氧化应激、钙代谢异常和细胞死亡。铁死亡——区别于凋亡和坏死的一种铁依赖性的细胞死亡调节形式,可能在缺血性心肌病中发挥重要作用。本研究通过对ICM中铁死亡相关基因的表达进行筛选和分析,探究铁死亡在ICM中可能发挥的作用。目的:探究铁死亡相关基因在ICM中的表达情况及其所发挥的生物学作用。方法:(1)ICM中差异性表达基因的筛选和分类;(2)差异性表达基因与铁死亡相关基因的共筛选及加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-Expression Network Analysis,WGCNA);(3)构建蛋白质互作网络;(4)对ICM中差异性表达铁死亡进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopaedia of Genes and Genomes,KEGG)分析;(5)枢纽基因的ROC验证;(6)通过CCK-8实验、实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(Quantitative real-time reverse transcription PCR,q RT-PCR)和蛋白质印迹分析(Western blotting analysis)验证关键基因的表达量是否存在差异;(7)针对枢纽基因进行药物预测。结果:(1)通过生物信息学分析,筛选出DEFRGs共19个,GO和KEGG分析显示这些基因功能主要涉及蛋白磷酸化、酶活性的调控以及条件平滑肌细胞增殖等方面,并可能通过HIF-1信号通路发挥作用;(2)通过构建蛋白互作网络和MCC算法,得出排名前10的枢纽基因,并对其进行ROC验证最终得到7个诊断性能良好的枢纽基因;(3)q PCR实验表明,在缺氧/复氧模型中,SLC40A1、SNCA以及GJA1的表达相较对照组有明显差异,且差异能够被铁死亡抑制剂Fer-1所抑制;(4)根据DSig DB数据库推测维甲酸可能对于SLC40A1、SNCA以及GJA1基因具有治疗作用。结论:在本研究中,通过对微阵列数据集GSE26887进行生物信息学分析,我们得到了SLC40A1、SNCA以及GJA1这3个枢纽基因,并通过实验证实上述基因在ICM中确实存在差异性表达,且能被铁死亡抑制剂Fer-1所抑制,证明上述基因有可能成为ICM病理生理过程中的潜在治疗靶点,为进一步研究ICM中铁死亡发挥作用的机制提供新的思路。
其他文献
学位
学位
学位
学位
积分制是近年来乡村治理实践中涌现出的新型治理手段。数字化积分制是数字经济和数字治理发展大背景下积分制运用的最新形式。本文认为,积分制的实质是一种基于规范的干预,亦即治理主体可以通过调动社会规范和道德,借助居民决策中对内在价值动机的重视,促进居民选择具有正外部性的亲社会行为。设计得当的积分制,可以通过正外部性行为的增益,实现村庄治理效能的提升,助力乡村内生发展动力的形成。本文通过梳理新古典经济学传统
期刊
引言:随着高分辨低剂量螺旋CT越来越多的被用于肺癌的筛查,使肺结节的发现更加普遍,且其中多数患者存在多发结节,加上诊疗手段的不断进步,使得诊断多原发肺癌(multiple primary lung cancer,MPLC)的比例在逐年上升。但目前学界对MPLC的病因、生理病理、诊断、鉴别诊断、治疗方案以及疗效预后等方面存在不同声音,且指南指导较为笼统。对于临床疑诊多原发肺癌的患者,手术仍是肺癌的主
学位
背景脊髓损伤(spinal cord injury,SCI)是一种严重的中枢神经系统(central nervous system,CNS)疾病,创伤性SCI(traumatic spinal cord injury,TSCI)是其中最常见的类型。TSCI可导致一系列严重的并发症,包括肺炎、肺不张、呼吸衰竭、尿路感染、肠炎、压疮、脓毒症、神经源性休克、深静脉血栓形成以及瘫痪、感觉障碍、抑郁和焦虑、
学位
学位
目的:评估钻孔引流联合脑膜中动脉(middle meningeal artery,MMA)栓塞术对慢性硬膜下血肿(chronic subdural hematoma,CSDH)治疗的安全性及有效性,并与单纯钻孔引流术治疗组的疗效和安全性进行对比。方法:收集2020年1月至2022年12月期间南昌大学第二附属医院收治的确诊为CSDH的患者,根据患者的治疗情况分为A和B两组,A组为接受钻孔引流联合MM
学位
在经济全球化背景下,地区经济发展水平是否会对离婚率产生影响是一个不容回避的现实问题。基于2014—2019年省级面板数据,运用混合回归法、固定效应模型等实证工具检验了地区经济发展水平对离婚率产生的影响,进一步分析了不同区域间表现出来的差异。研究结果表明,地区经济水平对离婚率具有显著的正向影响,且东中部地区经济发展水平对离婚率影响的显著程度明显高于西部地区。为此,在保证经济平稳运行的基础上,应对日益
期刊