漕运，是指中国历史上著名的内陆交通运输系统，主要是指由南向北，通过京杭运河运送官粮、军粮以及重要的大宗物资到达封建王朝统治中心的系统性工程，包括开发运河、制造船只、征收官粮、军粮等，广义的漕运还包括海运。漕运萌芽于秦汉，兴盛于唐宋，而明代则是漕运管理制度变革较为频繁的时代，对于研究漕运制度沿袭有重要的参考价值。明代的漕运制度大致经历了从明初“河海兼运”，到永乐十三年罢海运、陆运而专营河运，以及明中后期，由于漕运积弊严重，海运优势明显，朝廷和地方中出现了关于重开海运的争论，然而海运最终没有得以实施，明代最终由海洋走向了内河漕运。第一章首先总结了学术界的研究现状和背景，以及本文的创新点。第二章论述了明代漕运与海运的经济制度变迁进程，详细论述了从明初的河海兼运，到永乐年间罢海运、专行漕运，嘉靖、隆庆年间的河海之争，以及明末短暂的施行海运的制度变迁史。第三章对比了漕运、海运的经济社会环境以及各自的优劣势，说明了海运所具有的优势和技术可行性，为进一步的分析提供数据支持，在此基础上，第四章详尽分析了明代关于漕运系统变革的中央、地方政府的决策过程，从经济学的角度分析了漕运总督这一关键节点，同时运用博弈论的相关理论，对其条块分割体制形成的原因和影响进行分析，第五章进一步研究了大运河沿岸的中小利益集团对于政府决策的影响，以求从更加立体的视角审视这一史实。本文综合运用了文献研究法、比较分析研究法等方法，试图从漕运经济利益的角度分析明代的漕运制度，揭示这一历时数百年的历史事件背后所隐藏的深刻的政治、经济根源，说明了既得利益集团对于改革的阻力是海运没有实行的根本原因，希望能够弥补相关领域对于这一史实研究的不足，同时也为我国当前的全面深化改革提供历史经验和教训。