杨凌糖丝菌Hhs.015全基因组分泌蛋白的预测分析及诱导抗性相关蛋白筛选

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liaogch
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
杨凌糖丝菌Hhs.015(Saccharothrix yanglingensis)是由黄瓜根部分离获得的生防放线菌,前期大量试验表明该菌对番茄叶霉病、苹果树腐烂病有明显的防治作用,但目前对其防治机理还不清楚。本研究基于杨凌糖丝菌Hhs.015全基因组测序结果及预测分析到的分泌蛋白,通过构建表达载体,对分泌蛋白进行苹果树腐烂病抗病性检测分析及诱导抗性相关酶活检测,期望筛选得到与植物诱导抗性相关的外泌蛋白,为深入了解杨凌糖丝菌Hhs.015诱导抗性分子机制及苹果树腐烂病的防治奠定基础,为蛋白质生物农药的开发提供思路。本试验中采用相关软件综合分析杨凌糖丝菌基因组中7379条蛋白序列的信号肽、跨膜结构、锚定位点和亚细胞定位等特点,筛选出分泌蛋白并对筛选出的分泌蛋白信号肽的基本特征进行分析,将筛选出的分泌蛋白基因进行外源表达蛋白纯化后,检测蛋白对苹果树腐烂病抗病性及处理苹果叶片后诱导抗病性相关酶的活性。获得以下试验结果:1、利用SingnalP 4.1软件、TMHMM、PrositeScan和big-PIpredictor等程序对杨凌糖丝菌Hhs.015基因组分析预测,对所得的Hhs.015序列进行blast2go分析、功能注释、结构域预测及长度分布分析。分析得出杨凌糖丝菌Hhs.015含有分泌蛋白300个,约占总数的4.07%,其氨基酸长度大多集中在100~400 aa之间,比例约占56%;信号肽长度跨越范围较大,集中在23~27个aa序列之间;信号肽切割位点属于A-X-A类型。其中具有预测功能的外泌蛋白为158个,功能大多数集中在酶类,包括丝氨酸蛋白酶、转肽酶等。2、对筛选出的假定蛋白进行原核表达,从142个未知功能的假定外泌蛋白中挑选出氨基酸长度在100~400 aa的假定外泌蛋白29个,成功构建原核表达载体,对蛋白诱导表达条件温度、IPTG浓度及诱导时间进行优化,得到诱导最佳温度为16~18℃、IPTG最佳浓度为0.1 mmol/L及诱导时间为14~18 h,纯化获得6个候选假定蛋白编号:分别为5620g、1132g、194g、2349g、3176g、3638g。3、将诱导出的6种蛋白分别进行活性检测及抗病性检测。其中6种蛋白不能诱导烟草产生坏死反应。分别对经蛋白液浸泡10 min晾干后的苹果叶片接种苹果树腐烂病菌进行培养,结果经5620g蛋白液浸泡后的苹果叶片对苹果腐烂病菌的抗病性增强,抑制病斑的扩展。4、对5620g蛋白液进行防御酶活性检测。在5620g蛋白液处理苹果叶片后的第1、2、3、4、5、6天进行取样检测过氧化物酶(POD)、苯丙氨酸解氨酶(PAL)及多酚氧化酶(PPO)的活力。POD活性在第3天时达到最高值,与对照相比增加58.2%,PAL活性第3天显著提高113.8%,PPO活性在第4天活性显著提高。通过上述试验成功筛选得到一个植物诱导抗性相关的蛋白激发子5620g,为明确杨凌糖丝菌Hhs.015诱导抗性分子机制奠定基础。
其他文献
研究表明投资摩擦广泛存在于投资过程中,但是现有研究在测算资本回报率时却并没有将摩擦因素考虑进去,基于未考虑投资摩擦的资本回报率模型得到的资本回报率普遍高于实际值,
近年来,微电子技术发展迅猛,微热管以其高热导率、快速热响应、良好等温性等优点,成为了微电子产品散热的理想元件。微热管的传热性能主要取决于管内吸液结构,而传统工艺和方法制造出的吸液芯已经不能适应当前电子设备轻薄的发展趋势,为了改善当前热管吸液芯的制约,本文利用激光微织构技术制备出亲、疏水间隔通道的平板微热管,该间隔通道具有提高液滴输运能力的效果,以此提高了热管传热性能。主要工作如下:(1)通过微观形
环境温度的变化会改变光纤布喇格光栅(Fiber Bragg Grating),即光纤Bragg光栅的折射率变化周期和有效折射率,从而导致光纤Bragg光栅的中心波长发生偏移,分析波长偏移量即可达到准确测量温度的目的。新一代光栅阵列光纤传感技术采用光栅阵列传感器作为温度敏感元件,采用工业化的拉丝及光栅刻写一体化在线生产技术,它是一种可灵活配置的大规模、无接续、高精度、快速响应的多参量光纤传感新技术。
在中国市场经济飞速发展的条件下,中小企业的位置已经变得愈加重要,他们在我国的经济体中发挥着不容忽视的作用。但由于规模太小,信誉不高,抗风险能力有限等问题,中小企业在
土壤是重要的自然资源,是维系人类可持续发展的基石。经济社会的发展在创造巨额财富、便利生产生活的同时,也给土壤资源带来了无与伦比的压力。我国的土壤污染形势愈发严峻,
创业努力对创业目标的实现起到关键作用,然而创业进展与创业努力之间的关系尚存争议。社会认知理论指出,创业者的进展可以激励其为后续任务做出更多的努力,而控制理论则认为,人的惯性将抵消创业者对动机的短暂维持,从长远来看,创业进展不利于努力的改善。本文推测时间的长短可能会影响企业家进步与企业家努力之间的关系。社会心理学者指出,人们具有心理惰性,创业者在创业过程中所经历的成就感或挫败感最终会随着时间的流逝而
随着互联网技术和社交网络的飞速发展,微博用户的数量也在日益增加。在大数据时代,通过人工智能技术挖掘网络文本的情感倾向不仅有助于及时了解网络舆情,而且对完善微博产品
征地安置留用地,是指国家在依法征收农村集体土地后,计提一定比例的土地划拨给被征地农村集体经济组织,以用来保障失地农民长远生计的建设用地。留用地政策并没有在全国广泛
近年来随着金融行业的快速发展,银行业的竞争日益激烈,商业银行的业务和产品同质化越发严重,单一的从提高资产质量和规模或金融产品创新的角度已无法满足和实现商业银行快速发展扩张和利润增长的基本要求。因此,商业银行对于内部管理流程进行优化,提高自身的绩效管理水平,打造更高素质、更具竞争力的客户经理团队,通过提高客户经理的服务质量,明确服务目标,来推动商业银行的业务增长对于帮助其提升经营成果变得尤为重要,尤
喹唑啉骨架广泛存在于各种生物碱和具有生物药理活性的有机分子中,开始应用于抗疟原虫领域、抗菌领域。近几十年来,靶向治疗药物越来越受欢迎,个别喹唑啉衍生物成为靶向药物用于抗肿瘤,正是因为其优越的骨架和生物活性,成为研究的目标。将喹唑啉进行官能团修饰,引入不同取代基和其它骨架,对喹唑啉衍生物库扩充,为后续生物活性物质筛选做了铺垫。另外一方面1,3-偶极的活泼性和喹唑啉类化合物含氮导向基团,可以进行高立体