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鲿科隶属于辐鳍鱼纲、真骨下纲、鲇形目,分布于非洲和亚洲,现有21个属,220余种,为鲇形目中形态高度多样化的类群之一,其系统分类一直较为混乱。分子系统学为解决系统分类问题提供了新的工具。本研究以鲿科鱼类为研究对象,分别利用线粒体基因组全序列和细胞色素b (cytb)基因序列作为分子标记分析了鲿科鱼类系统发育关系并对其物种分化时间进行了估算,以期为鲿科鱼类的系统学研究提供理论依据。本论文的主要研究内容如下1、通过PCR方法获得鲿科暗灰唇齿鲿(Bagrichthys obscurus)、鲿(Bagrus bajad)、多克玛鲿(Bagrus docmak)、东方鲿(Bagrus orientalis)、大鳍鱯(Hemibagrus macropterus)、斑鳍半鱯(Hemibagrus spilopterus)、博氏鱯(Mystus bocourti)、秘鱯(Mystus mysticetus)、裂鱯(Mystus rhegma)、辛格鱯(Mystus singaringan)、泰国拟鱯(Pseudomystus siamensis)和中华海鲇(Tachysurus sinensis)12个物种的线粒体基因组全序列,其长度在16,521bp-16,796bp之间。通过与其他已知的鲇形目鱼类线粒体基因组序列进行比对,发现其结构和基因排列顺序与其他脊椎动物相似,由2个rRNA基因,22个tRNA基因以及13个蛋白质编码基因和一个非编码的控制区段组成。其碱基含量具有明显的AT偏倚性(57.8%)。鲿科鱼类线粒体基因组的长度不同,主要是由于非编码区序列长度的差异造成,博氏鱯(M. bocourti)非编码区序列最短(876bp),多克玛鲿(B. docmak)非编码区序列最长(1,151bp)。2、利用20种鲿科鱼类(代表了9属)的线粒体基因组全序列(12种为本研究所测定,其余8种从GenBank下载),结合从GenBank下载的29种鲇形目其他物种,以及外类群电鳗目(2种)、脂鲤目(2种)和鲤形目代表物种线粒体基因组全序列,采用贝叶斯法和最大似然法构建系统发育树。结果显示：(1)鲿科鱼类构成一单系类群；(2)东亚分布的黄颡鱼属(Pelteobagrus)、拟鲿属(Pseudobagrus)和鮠属(Leiocassis)形成一单系类群；(3)东南亚唇齿鲿属(Bagrichthys)和拟鳠属(Pseudomystus)构成姐妹类群关系；(4)鲿属(Bagrus)为一单系类群；而后与半鳠属(Hemibagrus)和鱯属(Mystus)构成一个大的单系类群；(6)中华海鲇(T. sinensis)并非如Ng&Kottelat (2007)提出的那样属于鲿科物种,而仍应为海鲇科的物种。3、利用50种鲿科鱼类(代表了15属)线粒体cytb基因序列(除11种为本研究所测外,其余数据来源于GenBnak),采用贝叶斯法和最大似然法构建系统发育树。结果显示：鲿科鱼类可分为六大类群,东亚黄颡鱼属(Pelteobagrus)、鮠属(Leiocassis)和拟鲿属(Pseudobagrus)形成一大类群；东南亚拟鱯属(Pseudomystus)、透明鲿属(Hyalobagrus)、矮鮠属(Nanobagrus)、鮠属(Leiocassis)和唇齿鲿属(Bagrichthys)形成一大类群；鲿属(Bagrus)、半鱯属(Hemibagrus)、鱯属(Mystus)和诺鲿属(Sperata)形成一大类群；南亚丽塔鲇属(Rita)、巴塔鲿属(Batasio)和下眼鲿属(Horabagrus)各自形成一大类群。4、运用松散分子钟方法估算了鲿科鱼类的分化时间。鲇形目鱼类的起源时间大约在114百万年前(白垩纪中早期)；鲿科鱼类的起源时间约在57.6Mya(古新世时期),东亚鲿科(黄颡鱼属、拟鲿属和鮠属)的起源时间约在42.2Mya,但种属物种分化时间主要集中在中新世至上新世时期(20.3-2.6Mya),推测这些物种多样性的形成可能与喜马拉雅-青藏高原的快速隆升和东亚地区的季风气候的形成紧密相关。鲿属(Bagrus)物种的起源时间约在27.0Mya,渐新世晚期,与化石记录时间(渐新世时期)相吻合,但主要类群分化时间集中在中新世时期。鱯属(Mystus)化石记录时间约在始新世时期,本研究估算的结果也与化石记录结果相吻合。