耐辐射球菌(Deinococcus radiodurans)是-种能产生红色色素、非孢子型的革兰氏阳性菌.由于其对电离辐射、紫外线和其它DNA损伤剂都具有极强的辐射抗性而备受人们关注. 我们运用氨基酸含量、蛋白质二级结构含量及高级结构特点对耐辐射球菌和其它已经测序,与其GC含量接近(介于65﹪-69﹪之间)的,最适生长温度也与其相近(在20到40摄氏度之间)的16个不抗辐射微生物的基因组进行了对比分析,以期能揭示耐辐射球菌基因组水平上的抗辐射机制.耐辐射球菌基因组大小为3.28 Mb,具有高的GC含量,它包括两个染色体、-个大质粒和-个小质粒. 对包括耐辐射球菌在内的十七种微生物氨基酸使用频率的比较分析结果表明,耐辐射球菌基因组中脯氨酸(p)的含量比其它细菌的高而天冬氨酸(D)和异亮氨酸(I)的含量比其它菌低.对RAI(RAI=D-I-P)值的分析可以更加鲜明的看到耐辐射球菌与其它16种菌在氨基酸使用频率方面的差别.对十七种微生物氨基酸二级结构含量(螺旋、折叠、转角)的分析结果表明,在耐辐射球菌基因组中转角含量比非辐射细菌高. 我们还运用Kadin的E(g)指标对包括耐辐射球菌在内的5个已经测序的抗辐射生物的基因组进行了密码予使用频率分析,结果显示:具有辐射抗性的生物的基因组中编码核糖体蛋白S3、S12,参与蛋白质折叠的转录因子和伴侣蛋白infB、RpoC、fusA、dnaK.、groEL、GroES和参与重组修复酶A蛋白的基因都具有很高的表达量,还有一些编码细胞壁表面结构和IABC通道蛋白的基因也具有高的表达值,这些都是与抗辐射能力有关的.而令人意外的是,除重组修复酶A即:RecA在五个菌种都有较高的表达值外,参与DNA直接修复、基本的切除修复和嘌呤/嘧啶(AP)内切酶,错配修复及其它重组修复的酶的表达值却不高.