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PI4KⅡα是哺乳动物细胞中含量丰富的一类膜相关激酶，定位在反式高尔基体网络、内涵体以及分泌囊泡中，大量的研究表明PI4KⅡα可以调节细胞内多种细胞活动，包括蛋白质的分选和转运，然而其具体调节机制目前尚未阐释清楚。本研究中，我们采用了一种研究动态瞬时蛋白相互作用的方法BioID（生物素指纹标记技术），结合质谱检测来鉴定与PI4KⅡα存在相互作用的重要靶蛋白。进一步我们将获得的靶点进行生物信息学聚类分析（GO分析），结果显示，与PI4KⅡα相互作用的蛋白质主要富集在蛋白翻译、细胞内蛋白转运、蛋白折叠以及代谢过程相关的四类生物学功能中。通过对蛋白质转运相关靶点的深度分析，我们发现CARTS复合物的组成成分Rab8，p115和Clathrin heavy chain1均与PI4KⅡα存在相互作用。CARTS复合物是一类可以将蛋白质从反式高尔基体运输到细胞质膜的运输载体，其中Rab8a，p115和synaptotaminⅡ是CARTS运输载体的组成成分，而且PKD是该运输载体合成所必需的一种激酶。CARTS复合物可以转运许多分泌蛋白和一些质膜特异性蛋白，例如胰腺癌上调因子(pancreatic adenocarcinoma up-regulated factor)，简称PAUF。为了确证PI4KⅡα与CARTS转运复合物的相互作用及调控关系，我们利用免疫荧光技术检测了PI4KⅡα与CARTS复合物组成成分及其经典转运货物蛋白PAUF的共定位情况，并利用CRISPR-CAS9技术方法在MCF-7细胞中敲除PI4KⅡα，检测其对PAUF分泌的影响。结果显示PI4KⅡα与Rab8a、PKD以及PAUF均有部分共定位，且PI4KⅡα敲除细胞系中PAUF的分泌显著升高。PKD对CARTS复合物从反式高尔基体到质膜的运输是必须的，因此我们检测了PI4KⅡα对CARTS的调控是否依赖于PKD活性调控。结果显示在PI4KⅡα完全敲除的单克隆细胞系中，PKD的活性相较于野生型MCF-7细胞显著升高，表明PI4KⅡα对PKD的活性存在负调控。我们进一步通过挽回实验验证该机制，我们利用PKD的抑制剂CID755673处理PI4KⅡα敲除细胞，结果显示抑制PI4KⅡα敲除细胞系中PKD的活性可以非常明显的挽回因PI4KⅡα敲除而造成的PAUF分泌升高的现象。综上所述，PI4KⅡα可以通过负调节PKD的活性从而特异性的调控一类分泌蛋白CARTS复合物转运，揭示了一种新的分泌蛋白调控机制，为PI4KⅡα在疾病治疗中的应用提供理论基础。