从上世纪九十年代开始,我国一直都是吸引外商直接投资最多的亚洲发展中经济体。截止到2012年底,流向中国的FDI达到了1270亿美元,居世界第二位。然而伴随着国际贸易市场竞争的白热化,低技术水平附加值的加工贸易已无法适应国际贸易市场的需要。如何提高我国区域自主创新能力,推动产业结构的优化升级,实现经济增长模式的转变已成为我国亟待解决的问题。本文旨在从实证的角度深入探究FDI对我国区域自主创新能力的影响机制。根据“发展门槛”效应,FDI在一定的条件下才会对一个地区的自主创新能力产生促进作用,为了使论文的研究更加具有代表性,笔者选取了吸引FDI最多、经济环境优越、基础设施发达的长三角地区作为研究对象。本文简要介绍了研究背景及意义、研究内容及方法。文章主要基于理论研究和实证研究。理论研究中主要阐述了国内外有关国际直接投资、技术溢出效应的研究,分析了FDI对创新能力的作用机制、自主创新能力测度模型、影响因素。实证研究中,首先统计分析了长三角地区FDI及自主创新能力的现状；然后进行实证检验,选取长三角地区10年的面板数据,利用FDI及FDI和人力资本存量的乘积两个不同的主要解释变量进行线性回归分析；并且利用长三角地区两省一市的数据逐个进行线性回归。文章的最后依据前文的理论和实证研究提出相应的政策建议。通过作用机制分析、现状比较研究以及实证检验,本文得到了以下结论：FDI和人力资本存量在交互作用下才会对区域自主创新能力产生促进作用,单一的FDI作为自变量的实证结果表明对区域自主创新能力没有显著的促进作用；一个地区的GDP和R&D内部经费支出与区域自主创新能力之间有正相关关系；一个地区的科技活动人数对区域自主创新能力有显著的抑制作用,导致这一结果可能的原因是投入到自主创新活动中的人员多少不能够代表该地区技术开发效率的高低；长三角地区两省一市经济发展模式的差异是导致FDI与自主创新能力之间的相关关系不同的原因。