氡染毒动物差异表达基因的高通量筛选

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目的:在建立氡染毒动物模型的基础上,筛选和鉴定氡染毒动物外周血细胞、骨髓细胞和气管-支气管上皮细胞差异表达基因,为探讨氡致肺癌的分子机制提供基础资料。方法:实验用HD-3型多功能移动式氡室,对BALB/c小鼠和Wistar大鼠动态吸入染毒,建立动物模型。按照实验动物吸入氡及其子体的累积剂量分为实验组(100WLM)和对照组(室内本底浓度,0.8WLM),每组4只动物。染毒时间每天8小时,每周6天。通过观察小鼠外周血、骨髓细胞和大鼠外周血的早期生物学指标以及气管-支气管的病理学改变,建立动物模型。取小鼠外周血细胞、骨髓细胞和大鼠气管-支气管上皮细胞,抽提总RNA,采用SMART cDNA和抑制性消减杂交(Suppression SubtractiveHybridization,SSH)技术,构建差异表达基因cDNA文库,TA克隆,选取含有插入cDNA片断的克隆进行反向Northern杂交筛选上调或下调的阳性克隆。阳性克隆的测序结果在GenBank Blast中进行同源性检索,同源性高的序列进行功能分析和生物信息学分析,同源性低的序列提交GenBank。用荧光实时定量PCR对最终得到的部分差异片断进行验证。结果:动物氡染毒100WLM后,小鼠外周血和骨髓细胞出现计数改变、脂质过氧化损伤和遗传学改变;大鼠外周血SOD活性降低和MDA含量升高,组织学检查出现明显的支气管炎性浸润。运用SMART cDNA和抑制性消减杂交成功构建了消减cDNA文库。挑取白斑1004个,获得837个含有插入片断的单克隆,进行反向Northern杂交,分析基因的上调或下调水平。选取差异表达克隆126个进行测序及生物信息学分析,最终获得44条已知功能或有注释差异基因片断,39条未知功能的已知差异基因片断,24条重复差异基因,19条未知EST,其中未知EST提交至GenBank,获得注册号。44条已知功能或有注释的差异基因的结果提示,筛选出的差别表达基因涉及氧化损伤、细胞增殖、凋亡、DNA损伤和肿瘤发生等多方面的功能。结论:1.建立了氡染毒的实验动物模型:构建了外周血细胞、骨髓细胞和气管-支气管上皮细胞的消减cDNA文库。2.共筛选出44条已知差异基因片断,功能涉及氧化损伤、细胞增殖和凋亡、DNA损伤和肿瘤发生;得到19条未知EST,提交至GenBank获得注册号。3.氡染毒可引起一系列基因表达的上调或下调,参与病理损伤和致癌过程,具体机理有待进一步研究。
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