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目的：滑膜肉瘤（SS）是间叶来源恶性肿瘤中病理形态和免疫组化同时表达上皮、间叶表型的最经典模型。本实验通过检测两种细胞成分之间上皮间叶转化或间叶上皮转化（EMT/MET）相关基因mRNA表达的差异，探讨激光捕获显微切割（LCM）和组织小芯片法两种分离方法在石蜡包埋福尔马林固定（FFPE）的 SS组织中应用的可行性，分析两种分离方法在石蜡包埋组织中的应用范围及优缺点，为进一步深入研究SS双相分化的机制提供有力技术支持。 方法：选取经病理组织学观察和免疫组织化学证实的FFPE滑膜肉瘤样本12例（双相型10例，单相纤维型2例），其中包括2例复发病例。应用ArcturusXT?系统LCM和组织小芯片法分离、纯化SS梭形细胞和上皮细胞，采用Trizol法提取RNA，运用荧光实时定量PCR检测EMT相关基因（E-cadherin、N-cadherin、Snail和Slug）在SS上皮细胞和梭形细胞中mRNA的表达，通过SPSS17.0软件进行统计学分析，采用独立样本及对照样本的T检验。 结果：（1）ArcturusXT?系统LCM收集约2×104个SS细胞后，可用于qRT-PCR，成功率75％（3/4）。（2）组织小芯片法分离FFPE SS组织，提取RNA的成功率为72.2%（13/18）。（3）11例梭形细胞RNA样本中，E-cadherin mRNA表达明显高于N-cadherin（2-△Ct平均值分别为3.2116，2.9253）；Snail mRNA表达明显高于Slug（2-△Ct平均值分别为22.5389，0.4985）；5例上皮样细胞样本中，E-cadherin mRNA表达略高于N-cadherin（2-△Ct平均值分别为2.9253，2.5628）；Snail显著高于Slug（2-△Ct平均值分别为8.54316，0.4089）；其中仅Snail的mRNA表达梭形区明显高于上皮区（P=0.001）。（4）两例复发病例中，原发组织的梭形区细胞中 E-cadherin、N-cadherin、Snail、Slug的表达均显著高于复发（P值分别为0.001、0.035、0033、0.022）。 结论：（1）EMT相关基因在滑膜肉瘤上皮间叶两种成分中表达存在差异，其中Snail的mRNA在间叶成分中显著高于上皮成分。（2）ArcturusXT?系统LCM和组织小芯片分离法均可用于石蜡包埋组织的滑膜肉瘤上皮间叶两种成分的分离、纯化，ArcturusXT?系统 LCM可精确获取高度纯化的目的细胞。