MicroRNA(miRNA)是一种广泛的存在于真核生物钟的一种内源性的非编码的RNA分子，它主要是在转录后的调控水平上行使其调控作用，它调控了人类大约三分之一的基因，是一种十分重要的调控因子。目前，研究miRNA与疾病，尤其是癌症的发生、发展过程中的关系已经成为了科学家关注的热点。当前的一个研究热点就是借助于表达谱来研究miRNA调控的疾病风险通路。　　全基因组范围的样本匹配的miRNA-mRNA表达谱可以被广泛的用来寻找疾病相关的兴趣miRNA和基因集合。利用这些兴趣集合，识别miRNA调控的通路对于研究miRNA在疾病发展过程中的作用是十分重要的。然而，传统的基于miRNA的通路识别方法未能考虑到通路的结构信息以及协同作用的miRNA的累积调控作用。我们提出有效的整合通路协同作用miRNA调控导致的表达变化以及通路的结构信息。我们用倍数变化来衡量miRNA和基因的表达变化。在SMRPP方法中，我们用拓扑性质，包括出度和介数中心性来衡量基因产物在整个通路中的影响。另外，我们利用随机游走的方法模拟了通路中各个节点间的相关关系。　　在SMRPP方法中，通过对多发性骨髓瘤以及前列腺癌两个数据集的分析，证实我们的方法在识别协同作用miRNA调控的疾病风险通路方面是有效以及可靠的。通过与其他方法的比较，我们发现通路的结构以及miRNA所调控的表达变化在识别疾病风险通路过程中都发挥了十分重要的作用，通过分析协同作用miRNA所调控的疾病相关靶基因在疾病发展过程中的作用，对协同作用miRNA的共表达分析以及分析它们在通过影响打分过程中所做贡献的分析，暗示了协同作用miRNA在识别风险通路的过程中十分重要的。在用随机游走识别的前列腺癌中的子通路与疾病相关性极为显著，子通路间交互作用在风险性较结构方面更显著。