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越南是东南亚地区一个具有丰富遗传多样性的国家。近些年来,虽然在动物遗传学上已经开展了很多研究,但是仍然需要深入地进行地方猪品种遗传多样性的分析。到目前为止,基于完整的线粒体基因组对越南地方猪种的遗传变异研究很少。因此,本研究的目的是分析越南MongCai猪、Ban猪和野猪的遗传多样性。在越南Son La省,共采集了三个品种/猪种的耳组织样品,在样本采集的同时也对MongCai猪和Ban猪的表型进行了记录。通过提取样品中的总DNA得到这些猪种的整个线粒体基因组序列,然后与中国地方猪种进行比较,采用Neighbor-Joining和UPGMA方法,构建了7个越南和145个(从Genbank数据库下载)来自中国、台湾,韩国,日本和欧洲的猪完整线粒体基因组的系统发育树。本研究结果如下:1.对越南两个地方品种猪进行了系统调查,包括75头MongCai猪和40头Ban猪,收集了毛色,繁殖性状数据,采集了耳组织样品,另外还采集了2头野猪的组织样品。2.Mong Cai猪的繁殖性能高于Ban猪。Mong Cai猪的总乳头数平均为13.47个,而Ban猪只有11.35个。Mong Cai和Ban猪的窝产仔数分别为11.8头和7.66头,平均出生个体重分别为0.54kg和0.44kg,断奶仔猪重分别为5.57kg和4.46kg。3.Mong Cai猪、Ban猪和野猪的整个线粒体基因组均含有37个编码基因,其中包括2个核糖体RNA,13个蛋白质编码基因,22个转运RNA基因和1个控制区。每个个体的整个线粒体基因组的总长度具有差异,约16.5~16.7kb,含有34%的碱基A,25%的碱基T,26%的碱基C和13%的碱基G,A和T较为丰富(约占60%)。4.系统发育树表明越南猪和中国猪的亲缘关系比较近,特别是Mong Cai猪和巴马香猪具有很近的遗传关系,Ban猪和Banna微型猪以及滇南小耳猪较近。有趣的是,越南野猪和很多中国猪品种具有共同的祖先。中越两国之间较近的地理位置和人及动物的频繁交流可能是这些猪品种间较近遗传距离的原因。5.通过计算亚洲地区猪群之间的遗传距离,结果表明,与欧洲相比,亚洲国家之间猪群有着更小的遗传距离,其中,中国猪与日本猪种的遗传距离最近(0.0010)。本研究结果为今后的研究提供了重要的基础性遗传数据。