mcr-1基因是迄今为止国际上首次发现的质粒介导的黏菌素耐药基因,可介导肠杆菌科细菌对多粘菌素类药物产生耐药,并可通过质粒或其他可移动原件在不同来源菌种间快速、广泛地传播,严重威胁人类健康和公共安全。本研究对食品动物中mcr-1阳性沙门菌进行研究,研究mcr-1基因在动物源沙门菌中的传播机制。本研究对2013~2014年分离自5个屠宰场的142株动物源沙门菌采用PCR方法检测mcr-1基因,结果显示21株(14.8%)沙门菌携带有mcr-1基因,包括19株鼠伤寒沙门菌(Salmonella Typhimurium)、1株德尔卑沙门菌(Salmonella Derby)和1株伦敦沙门菌(Salmonella London)。采用琼脂稀释法和微量稀释法测定21株mcr-1阳性沙门菌株对13种抗菌药物的敏感性。结果显示mcr-1阳性沙门菌的黏菌素最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)值介于1~2 mg/L之间,80%以上的mcr-1阳性菌对复方新诺明、氨苄西林、庆大霉素、链霉素、氟苯尼考和四环素耐药,对环丙沙星的耐药率为76.2%,所有阳性菌株都呈现不同程度的多重耐药现象。采用PCR方法检测21株沙门菌中的其它耐药基因。结果显示,分别有20和19株沙门菌携带floR和oqxAB基因。采用多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)对mcr-1阳性菌株间进行亲缘性分析。结果显示大部分菌株存在克隆传播关系,其中19株鼠伤寒沙门菌均为ST34型。由于多次接合转移试验失败,最终通过化学转化试验获得3株转化子,采用PCR方法检测转化子中其他耐药基因的携带情况,发现3株转化子同时携带oqx AB和floR耐药基因。采用PCR-mapping方法对mcr-1基因上下游侧翼序列进行分析,发现21株沙门菌中mcr-1基因的上游均检测到插入序列ISApl1。对21株mcr-1阳性沙门菌及3株转化子进行S1-PFGE和Southern杂交,除一株菌外,mcr-1基因多定位于一~180 kb的质粒上。通过高通量测序分析SH138(ST34鼠伤寒沙门菌代表株)全基因组DNA、SH36(海德堡沙门菌)和HNZ319S(伦敦沙门菌)转化子中的mcr-1阳性质粒序列,结果显示三株沙门菌中mcr-1均位于一IncH I2-F4:A-:B5质粒,具有典型的IncHI2型质粒骨架和部分IncF型质粒骨架,且质粒多重耐药区中包含有多种耐药基因,包括oqxAB、floR、sul1、cmlA和aadA2。综上所述,国内屠宰前猪源沙门菌中mcr-1基因的流行可能是ST34鼠伤寒沙门菌克隆传播、插入序列ISApl1和mcr-1阳性质粒水平传播共同作用的结果。其他耐药基因与mcr-1基因在IncHI2-F4:A-:B5质粒上的检出,提示其他临床、兽医常用抗菌药物的大量使用也是mcr-1基因快速传播的原因之一。