Myoneurin(MYNN)是BTB和锌指蛋白家族的成员。该家族在转录的抑制和激活、细胞骨架的构建以及染色质重塑上发挥重要作用。可变剪接是机体蛋白质组多样性的主要来源,并在很大程度上影响蛋白质的功能。研究发现,MYNN基因在人和鼠上都存在可变剪接,且MYNN可能在人的肌肉组织中调控某些基因的表达。然而,目前关于猪MYNN基因的可变剪接及功能的研究未见报道,因此,本试验以大白猪和马身猪为研究对象,通过RNA sequencing(RNA-seq)、PCR及克隆等技术鉴定了猪MYNN基因在肌肉组织中的可变剪接类型,并采用实时荧光定量PCR(qPCR)技术对MYNN基因各转录本在90日龄大白猪和马身猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小脑、小肠、胃、胰脏、肌肉、脂肪11个组织的表达谱以及各组织在1,90,180日龄不同阶段的发育性表达规律进行研究。结果如下:(1)在大白猪和马身猪的肌肉组织中鉴定出了 MYNN的两个新的转录本,分别命名为MYNN-1和MYNN-2。通过克隆肌肉组织中MYNN-1和MYNN-2的全长CDS区,发现MYNN-1比MYNN-2长84 bp,恰为第六外显子,且剪接位点的3’剪接受体和5’剪接供体位点符合GT-AG法则。其中,MYNN-1含8个外显子,其CDS区全长为1830bp,编码609个氨基酸;MYNN-2含7个外显子,CDS区全长1746bp,编码581个氨基酸。在跳跃的84 bp的核苷酸上存在4个ZF-C2H2(zinc finger,C2H2-type)功能结构域。(2)MYN-1和MYNN-2在大白猪和马身猪的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小脑、小肠、胃、胰脏、肌肉和脂肪中都有表达,且各组织间表达差异显著。在相同猪种中,MYNN-1与MYKN-2的表达规律基本相同,其中MYNN-1和MYNN-2均在脂肪中表达量最低。在大白猪上,MYNN-1与MYNN-2在小脑中的表达量最高,其次为肝脏、胃、脾脏、肾脏;在马身猪上,MYNN-1与MYNN-2在胃中的表达量最高,其次为脾脏、小脑、小肠、肝脏、肾脏;而对于不同猪种,在肝脏、脾脏、肾脏及脂肪中,MYNN-1和MYNN-2在大白猪上的表达量显著高于马身猪,而在肺脏、小肠、胃、胰脏组织中相反;猪MYNN的两个亚型在大白猪和马身猪的小脑、肝脏、胰脏、胃等组织中表达量较高且组织间差异显著。(3)为进一步研究MYNN在猪肌肉中的功能,我们检测了MY N-1和MYNN-2在三种肌肉组织中的发育性表达规律,结果显示:大白猪和马身猪在三种骨骼肌的不同发育阶段差异显著,在背最长肌、股二头肌和腰大肌的发育性表达规律各不相同,但从整体来看有相同的趋势。在相同猪种中,MYNN-1与MYNN-2的表达规律基本相同,对于大白猪,MYNN-1和MYNN-2的表达量在1-90日龄阶段表达量比较高,在90-180日龄阶段的表达量相对较低;对于马身猪,MYNN-1和MYNN-2的表达量在1-90日龄阶段表达量比较低,在90-180日龄阶段的表达量相对较高,这与在大白猪上的规律相反。(4)分析表达谱发现,猪MYNN的两个亚型在大白猪和马身猪的小脑、肝脏、胰脏、胃等组织中表达量较高且组织间差异显著。因此,我们进一步研究了猪MYNN的两个亚型在大白猪和马身猪的小脑、肝脏、胰脏、胃等7个组织的发育性表达规律:MYNN的两个可变剪接体的表达规律在小脑、肝脏和胃三个组织中具有相同的趋势,其在大白猪的1,90,180三个发育阶段的表达量逐渐升高,在马身猪上依次下降。且在其他几个组织的1,90,180日龄三个阶段都有一定的规律,这与MYNN基因在特定组织发挥的特定功能有关。(5)在大白猪和马身猪90日龄的各个组织中,MYNN-1mRNA的表达水平显著高于MYNN-2,整体来说在猪上MYNN-1是MYNN的主要亚型。分别研究各个组织的发育性表达规律时发现,在马身猪的肌肉、小脑、肝脏、脾脏、胰脏、胃、肾脏、肺脏组织以及大白猪的背最长肌,腰大肌、小脑、肝脏、脾脏、胰脏、胃组织中,MYNN-1是主要的亚型。而在大白猪的股二头肌、肺脏和肾组织中,MYNN-2为主要亚型。综上所述,MYNN在大白猪和马身猪的肌肉组织中存在两种可变剪接,其中MYNN-1为主要亚型。MYNN的两个亚型可能在猪的肌肉、小脑、肝脏、脾脏、胰脏、胃脏、肾脏、肺脏组织中发挥重要作用,其功能与组织、发育阶段以及猪种的遗传背景有关。