杨树(Populus)是广泛分布在北半球温带和寒温带的森林树种，因具有生长迅速、适应性强、容易繁殖以及遗传多样性等优点，成为研究的主要树种。随着全球环境的变化干旱的发生也越来越频繁，嫁接被证明是一种提高植物生产力和抗逆性的有效方法，但关于抗旱性不同的杨树进行种间嫁接后是否能产生最优嫁接组合及由嫁接引起的生理响应差异的可能分子机制的研究还未见报道。本研究以青杨(Populus cathayana)和美洲黑杨(Populus deltoides)无性系为试验材料，通过自身嫁接和种间交互嫁接处理共得到四种不同嫁接组合:C/C(青杨自身嫁接)、C/D(青杨做接穗美洲黑杨做砧木)、D/D(美洲黑杨自身嫁接)、D/C(美洲黑杨做接穗青杨做砧木)，四种嫁接组合的成活率均达到95％以上并生长良好。经过两种水分梯度(100％和30％田间持水量)处理，研究不同嫁接组合对干旱胁迫的生理响应差异，从而得到最优嫁接组合;同时借助Illumina转录组学测序技术和iTRAQ定量蛋白质组学技术对正常生长条件下的四种不同嫁接组合分别进行叶片转录组学和叶绿体蛋白质组学研究及两组学的关联分析，探究嫁接影响植物生长的分子机制。本研究获得的主要结果如下:　　(1)青杨无性系和美洲黑杨无性系交互嫁接对干旱胁迫的生理响应　　不同嫁接组合对干旱胁迫的生理响应差异较大。试验结果表明:干旱胁迫显著降低了所有嫁接组合的生长速率、生物量积累、净光合作用速率（Pn）、黎明前叶片水势(Ψwp)、叶片的相对含水量(RWC)和总可溶性糖(TSS)，显著增加了内在水分利用效率(WUEi)、叶片和根的脯氨酸含量。美洲黑杨做砧木的嫁接组合(C/D和D/D)，其幼苗的生长、光合速率和细胞超微结构在干旱胁迫下受到的影响较小;相比之下，青杨做砧木的嫁接组合(C/C和D/C)对干旱胁迫更敏感，其水分利用效率和渗透调节能力较低，说明嫁接植物的抗干旱胁迫能力主要取决于砧木而不是接穗。此外，与其他嫁接组合相比，把青杨接穗嫁接到美洲黑杨的砧木(C/D)上被证明是在两种水分条件下最好的:100％田间持水量条件下，C/D嫁接幼苗具有较快的生长速率和较高的地上部分生物量积累;30％田间持水量条件下，C/D的光合速率和水分利用效率较高、非结构性碳水化合物含量较高、渗透性调节能力更强，生长较好。由上可知，种间嫁接能提高杨树的抗旱性，我们的试验结果为杨树的栽培提供了新方法和理论基础。　　(2)青杨无性系和美洲黑杨无性系交互嫁接引起的差异表达基因研究　　转录组学结果显示与青杨自身嫁接相比，把青杨接穗嫁接到美洲黑杨砧木上，检测到277个差异表达基因(239个表达上调，38个表达下调)，差异表达基因的功能与细胞壁、激素合成与信号转导、次级代谢产物的生物合成、转录调控、脂代谢、氨基酸代谢等相关;与美洲黑杨自身嫁接相比，把美洲黑杨接穗嫁接到青杨砧木上，检测到287个差异表达基因(181个表达上调，106个表达下调);差异表达基因的功能与光合作用、激素合成与信号转导、转录调控、次级代谢产物的生物合成、脂代谢、蛋白质的合成与修饰等相关。总之，青杨和美洲黑杨的种间嫁接主要通过调控与植物激素合成与信号转导、细胞壁的修饰与合成、次级代谢产物的生物合成、转录因子的调控、脂代谢和蛋白质的合成与修饰等方面的基因表达来促进杨树幼苗的生长发育，并且各个过程之间相互协调和促进，这为种间嫁接促进植物生长发育提供了分子基础。　　(3)青杨无性系和美洲黑杨无性系交互嫁接引起的差异表达蛋白质研究　　青杨和美洲黑杨的种间嫁接幼苗的叶绿体蛋白质组学结合其叶绿体的超微结构、叶绿素浓度及光合生长等方面分析发现:种间嫁接幼苗叶绿体中的基粒类囊体数目和叶绿素浓度增加，为植物较高的光合生长提供生理基础。叶绿体蛋白质组学分析表明，与自身嫁接相比，种间嫁接能引起叶绿体蛋白质的差异表达。其中与青杨自身嫁接相比，把青杨嫁接到美洲黑杨砧木上，共有13个蛋白质出现差异表达(11个表达上调，2个表达下调);与美洲黑杨自身嫁接相比，把美洲黑杨嫁接到青杨砧木上，共检测到23个差异表达蛋白质(13个表达上调，10个表达下调)。两者检测到的共同差异表达蛋白质，尤其是与光合作用相关的如ATP合酶蛋白质(ATPA、ATPC)、光系统Ⅱ反应中心蛋白质(PSBB)、放氧复合体蛋白质(PSBP、PSBO)和捕光叶绿素a-b结合蛋白质(LHCO)等的共同上调表达，可能是种间嫁接提高植物的光合速率、促进嫁接幼苗生长的分子基础。　　另外，转录组学和蛋白质组学的关联分析显示，两者共关联到49个基因/蛋白质，说明两者的关联性较低，这可能与细胞器层面的蛋白质较少及存在丰富的转录后调控有关。通过GO注释分析表明关联到的基因/蛋白质主要集中在细胞过程、代谢过程、细胞组分、细胞器、结合和催化活性等条目上。其中，与叶绿体和光合作用相关的如光系统ⅡCP47蛋白、叶绿素a-b结合家族蛋白和叶绿体内膜导入蛋白Tic22等在种间嫁接幼苗的转录和蛋白质水平的上调表达，也为嫁接幼苗较高的光合能力提供了理论依据。