【摘 要】
：
目的:前列腺癌（prostate cancer,PCa）是男性第二常见的恶性肿瘤,但其致癌机制尚不清楚。我们的研究旨在探讨增强子RNA（enhancer RNAs,e RNAs）对前列腺癌发生发展的影响,并确定可能的PCa生物标志物。方法:利用癌症基因组图谱数据库（The Cancer Genome Atlas,TCGA）,通过bootstrapping、Kaplan-Meier（KM）生存分析、
论文部分内容阅读
目的:前列腺癌（prostate cancer,PCa）是男性第二常见的恶性肿瘤,但其致癌机制尚不清楚。我们的研究旨在探讨增强子RNA（enhancer RNAs,e RNAs）对前列腺癌发生发展的影响,并确定可能的PCa生物标志物。方法:利用癌症基因组图谱数据库（The Cancer Genome Atlas,TCGA）,通过bootstrapping、Kaplan-Meier（KM）生存分析、Spearman相关系数分析、LASSO（least absolute shrinkage and selection operator）等统计学方法对与PCa患者预后显著相关的e RNAs及其靶基因进行初步筛选。然后,我们建立了PCa风险评分模型,并在其他三个验证队列中验证了该风险评分模型。此外,我们还通过功能分析探讨了e RNAs影响前列腺癌发生发展的机制。此外,我们还通过癌症药物敏感性基因组学（Genomics of Drug Sensitivity in Cancer,GDSC）分析了前列腺癌的2种常用药物敏感性,并通过连通性图（Connectivity Map,CMAP）探索了潜在的前列腺癌治疗药物。在我们的研究中,包含了四个公共数据库中的共835个前列腺样本。结果:我们通过筛选得到了3个与前列腺癌预后相关的eRNA驱动基因（MAPK15,ZNF467和MC1R）,并建立了一个与前列腺癌无病生存期（disease-free survival,DFS）相关的预后风险模型。风险模型在训练和验证队列中都表现良好。此外,我们还发现该风险模型所包含的基因在免疫细胞浸润和基因突变过程中显著富集。通过差异性分析,我们发现肿瘤微环境（tumor microenvironment,TME）、免疫细胞、DNA突变、肿瘤突变负荷（tumor mutational burden,TMB）、微卫星不稳定性（microsatellite instability,MSI）在高、低风险组之间存在显著差异。通过药敏分析,我们发现2种常用前列腺癌治疗药物的IC50在高、低风险组中有显著性差异。另外,我们用CMAP筛选了10种可能用于治疗PCa的小分子化合物。结论:本研究确定了一个与前列腺癌患者DFS显著相关的3个靶基因并建立了1个稳健的预后模型。此外,我们初步探讨了e RNA影响前列腺癌发生进展的机制。
其他文献
目的:来那度胺在抗肿瘤、抗血管生成和免疫调节方面发挥了重要作用。本研究旨在系统评价来那度胺联合R-CHOP（利妥昔单抗联合环磷酰胺、阿霉素、长春新碱、泼尼松）治疗初治弥漫大B细胞淋巴瘤的疗效及安全性。方法:在Pubmed、the Cochrane Library、EMBase、中国知网、万方数据库中,检索从建库到2021年2月发表的,有关来那度胺联合R-CHOP治疗初治弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBC
目的:探讨神经导航辅助下神经内镜行经蝶入路垂体瘤切除术的临床疗效分析。方法:回顾性分析2018年5月至2020年12月期间我院神经外科收治的233例垂体腺瘤患者,排除未行手术者及其他手术方式及数据不全者共111例纳入研究,其中62例采用单纯神经内镜手术治疗,剩余49例采用神经导航辅助的神经内镜手术治疗,比较两组患者的临床资料及肿瘤全切率、手术时长、术中出血量、住院时长、术后并发症。结果:导航组与对
目的:探究术前不同桥本甲状腺炎（Hashimoto thyroiditis,HT）相关抗体状态对甲状腺乳头状癌（papillary thyroid carcinoma,PTC）发展及转移的影响,为临床决策提供理论依据,对于不同抗体状态下的PTC患者施行更有针对性治疗,避免过度医疗及防止医疗不足。方法:回顾性分析2020年1月-2020年12月就诊于山西医科大学第一医院普通外科的155例确诊为PTC
目的:评估血清胰岛素样生长因子结合蛋白7（IGFBP7）在结直肠癌（CRC）和结直肠息肉中是否存在差异,并进一步探究血清IGFBP7对结直肠癌可能的临床意义。方法:采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测尚未抗癌治疗的CRC患者（n=46）、CRC根治术后患者（n=20）及结直肠息肉患者（n=20）的血清IGFBP7水平,比较各组间水平差异。采用受试者工作特征（ROC）曲线、ROC曲线下面积（AUC
目的:系统评价伊布替尼单药治疗慢性淋巴细胞白血病（chronic lymphocytic leukemia,CLL）的有效性和安全性。方法:在中国知网、万方数据库、维普数据库、pubmed、web of science,embase、cochrane library等数据库中进行文献检索,对符合纳入标准的文献进行质量评价并提取相关数据资料。使用Stata15.1统计软件进行统计学分析,统计总反应率
目的:研究LAG-3在胶质母细胞瘤中的表达情况、潜在功能、预后及临床意义。方法:首先,通过检索GEPIA数据库、Oncomine数据库和UALCAN数据库分析LAG-3在GBM与正常脑组织、以及人种、性别、年龄的表达信息及表达差异,并进一步进行生存分析;通过免疫组化法进LAG-3在GBM中的表达验证;在Oncomine数据库检索出与LAG-3共表达的15个基因,使用Omicshare在线软件对基因
目标:前列腺癌（prostate cancer,PCa）是男性第二高发的恶性肿瘤,发病率约占男性恶性肿瘤的13%,并且发病率逐年升高。本研究目的主要是探究DNA甲基化在PCa发生发展中的作用以及寻找可以作为PCa诊断及预后的生物学标记物。方法:从TCGA（The Cancer Genome Atlas）下载PCa组织与癌旁组织的转录组数据,DNA甲基化数据,利用R软件对DNA甲基化数据与转录组数据
In this paper, we have proposed a novel encryption scheme with chaotic process based on Enigma. The encryption scheme takes the advantage of the approximate non-linear mechanism of original Enigma, wi
目的:肾透明细胞癌（clear cell renal cell carcinoma ccRCC）是肾癌中最常见的类型,本研究旨在基于癌症基因组图谱（TCGA）数据的基础上,建立一个列线图来方便评价ccRCC患者的预期生存。方法:将从TCGA数据库中下载的ccRCC DNA甲基化的数据和转录组的数据进行依次分析,分别得到了DNA甲基化驱动基因（DNA methylation driven gene,
目的:探讨术中额窦开放不同处理方式与术后颅内感染的相关因素方法:回顾性分析了山西医科大学第一医院2007年1月1日-2019年12月31日的159例术中额窦开放患者。查阅相关资料,统计额窦处理方式,同时记录预防性使用抗生素天数、引流管放置以及术后是否有颅内感染等数据。采用单因素和多因素Logistic回归分析额窦开放不同处理方式和颅内感染的相关性。结果:本研究共纳入159例术中额窦开放患者,其中术