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目的:特发性矮小(idiopathic short stature,ISS)是一种多基因作用而导致的疾病。其原因尚未明确,是一个异质性疾病,遗传因素在其中起到主要作用。ISS主要表现为垂体-生长激素-胰岛素样生长因子1轴和骨骼生长板功能异常。基于以上认识,本研究将从垂体-生长激素-胰岛素样生长因子1轴-生长板功能相关基因位点SNP的多态性对ISS进行一个初步的探讨。方法:1.采用氯仿苯酚抽提法对70例病例组进行DNA提取,所提DNA采用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA。2.抽取的70例病例组DNA,在Illumina Goldengate基因分析平台上对GHR基因和IHH基因上的5个位点进行tSNP分型,测定等位基因和基因型分布频率。3.对分型结果结果进行Hardy-Weinberg遗传平衡定律检验,确定各基因型频率是否达到遗传平衡,具有群体代表性。4.分型结果再与378例正常人群对照进行等位基因、基因型以及显性模式和隐性模式下的基因型分布频率的χ~2检验,其基因型及等位基因的相对危险度以优势比(Odds ratio,OR)及95%可信(CI)表示。5. 70例病例组测定其身高、坐高、指距、体重等指标,采用叶氏骨龄评分系统计算其骨龄(bone age,BA),并在各项临床指标间进行Pearson相关分析。6.在70例病例组内各基因型间分析其各项临床指标,两组间采用t检验,三组间采用单因素方差分析。7. 70例病例组和另外纳入的性别、年龄与之匹配40例正常儿童对照组一同,采用酶联免疫吸附测定法(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)测定血清IGF-1、IGFBP3水平,并进行两组间的比较,分析其诊断ISS的价值。结果:1、IHH基因的rs3099位点基因型以及等位基因频率分布的改变与ISS相关,GG基因型及G等位基因是ISS的易感性类型2、GHR基因的rs12515480位点基因型以及等位基因频率分布的改变与ISS相关,TT基因型及T等位基因是ISS的易感性类型3、ISS患儿IGF-1水平低于正常儿童对照组、IGFBP3高于正常儿童对照组,rs12515480位点各基因型之间IGF-1、IGFBP3水平无差异。4、ISS患儿下肢长坐高比值与遗传靶身高呈正相关,提示其下肢骨生长潜能的减低。5、IHH基因的rs3099位点基因型以及等位基因间下肢长坐高比的比较较无统计学意义,提示IHH基因可能对躯干骨的作用大于对四肢骨作用。结论:1、ISS与GHR基因rs12515480位点以及IHH基因rs3099位点的SNP存在关联,是一个多基因、异质性疾病。2、进一步证实SNP作为第三代遗传标志,是研究ISS等多基因疾病的最有力的工具之一。3、ISS患儿除了有生长激素分泌作用异常外,还应该重视其四肢骨生长板潜能的受损情况。