论文部分内容阅读
我国黄牛品种具有适应性强、肉质良好、耐粗饲等优良品性,在一些具有较好肉用特征的群体中,通过对现有品种高强度的选择培育,在一定程度上可缩短培育周期,加快实现培育出中国特色的优质肉用牛品种,但传统的选育方法周期长,易受环境因素影响,很难较快的选育出能稳定遗传,满足人们肉质需求中国肉牛品种。通过对单核苷酸多态性(SNPs)的研究,将其作为家禽家畜的育种标记辅助,在选育上具有很大的发展潜能。目前已检测出大量对家禽家畜重要经济性状有影响的的基因变异,为改良育种提供了理论基础。KCNJ12基因在心肌细胞,神经元中普遍表达,在肿瘤治疗以及肌肉运动调节上发挥着重要作用,此外,在当前牛全基因组关联分析研究中发现KCNJ12基因与牛体尺性状存在一定的关联性。而对KCNJ12基因的SNPs方面的研究尚未有报道。因此,本研究以KCNJ12基因为研究对象,主要通过PCR-RFLP技术和Tetra-primer ARMS-PCR技术,分析该基因上的四个SNPs位点在晋南牛、夏南牛和皮南牛三个中国黄牛品种在遗传效应上的影响。并通过在秦川牛不同组织表达情况的试验研究得出KCNJ12基因在中国黄牛的部分组织表达情况。本研究主要取得以下结果:1.在中国黄牛KCNJ12基因上检测到四个SNPs位点,具体为SNP1:g.35992774T>G;SNP2:g.35953919 A>G;SNP3:g.35989944 T>C;SNP4:g.35956326 G>A。其中SNP3:g.35989944 T>C位于第三外显子,等位基因T突变为C时,发生错义突变,对应氨基酸由半胱氨酸突变为精氨酸。2.在本研究选用的三个中国黄牛群体中,多态信息含量表明这四个位点均处于中度多态(0.25<PIC<0.5)。卡方分布检验结果显示,皮南牛群体在四个位点的变异在遗传中并不稳定,属于哈代-温伯格不平衡状态(P<0.05),说明改良的皮南牛群体已有打破原遗传平衡的趋势这种变异在遗传育种上具有重要研究价值。3.SNP1与三个黄牛群体关联分析表明在皮南牛中与体高和腰角宽呈显著相关(P<0.05),与体斜长和胸围呈极显著相关(P<0.01);SNP1位点在晋南牛中与十字部高呈显著相关(P<0.05),与体斜长、胸围和尻长呈极显著相关(P<0.01);在夏南牛中与十字部高呈显著相关(P<0.05),与胸围呈极显著相关(P<0.01)。4.SNP2关联分析表明在晋南牛中与体高和胸围呈显著相关(P<0.05),仅与尻长呈极显著相关(P<0.01);在夏南牛中与体高、十字部高和体重三个体尺性状中均有极显著关联(P<0.01),同时管围与该位点显著相关(P<0.05);在皮南牛中与十字部高呈显著相关(P<0.05),与体高、体斜长、胸围、腰角宽和尻长均呈极显著相关(P<0.01)。5.SNP3与三个黄牛群体关联分析表明在晋南牛中与胸围呈显著相关(P<0.05),与体高和十字部高呈极显著相关(P<0.01);SNP3与试验用的夏南牛体尺性状关联分析发现,SNP3与胸围、腹围和体重呈极显著相关(P<0.01);在皮南牛中与体高和尻长呈显著相关(P<0.05),与体斜长、十字部高、胸围和腰角宽呈极显著相关(P<0.01)。6.SNP4突变位点在晋南牛中与体斜长和胸围呈显著相关(P<0.05);在夏南牛上与胸围呈极显著相关(P<0.01)关系,与腹围呈显著相关(P<0.05);该位点与皮南牛的体斜长、十字部高、胸围和腰角宽呈显著相关(P<0.05),与尻长均呈极显著相关(P<0.01)。7.对秦川胎牛的组织样进行试验定量分析,得出表达谱并发现在试验六种组织中肌肉组织中有最高量表达。