以H2A-H2B基因间隔区和Cytb为标记探讨果蝇的系统发育关系

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果蝇的分类和系统学一直是许多研究计划的主题.自从Sturtevant(1921)、Patterson和Stone(1952)、Throckmorton(1975)和Wheeler(1981,1986)等人著书立说为果蝇研究作出里程碑式的贡献以来,果蝇作为模式生物的地位逐渐根深蒂固.近年,Grimaldi(1990)提出了果蝇的分枝分类学说,各种分子技术也应用于此类研究,它们使得果蝇热再度升温.但是,作为双翅目昆虫纲中代表性物种、拥有多达4000多个种的果蝇,其系统发育的许多问题仍亟待解决(见前言).通过PCR直接测序和克隆测序的方法获得了以下属和亚属的H2A-H2B基因间隔区序列和线粒体基因Cytb序列:条果蝇属(GenusPhorticella),花果蝇属(Genus Scaptodrosophila),姬果蝇属(Genus Scaptomyza),条纹果蝇亚属(Subgeus Dorsilopha),水果果蝇亚属(Subgenus Sophophora),果蝇亚属(Subgenus Drosophila).以上的三个亚属组成果蝇属(Genus Drosophila).以Ph.argentostriata(H2A-H2B基因间隔区序列)或Sd.psychotriae(线粒体基因Cytb序列)为外群,利用最大似然法、最大简约法、邻接法和Bayesian法构建系统树,对其系统发育关系进行了分析,并利用bootstrap对分析结果进行了置信度检验.研究结果表明:(一)姬果蝇属与果蝇亚属的亲缘关系较近,条纹果蝇亚属与水果果蝇亚属亲缘关系较近,条果蝇属早于水果果蝇亚属和果蝇亚属分化,水果果蝇亚属近乎早于果蝇亚属分化.(二)果蝇亚属分为二大谱系:1)polychaeta-repleta-robusta-virilis.不同的树对它们的系统发育关系有不同的描述,且置信度普遍较高.2)bizonata-funebris-histrio-quinaria-testacea.(三)水果果蝇亚属分为三大谱系:1)obscura;2)montium;3)suzukii-ananassae-melanogaster-takahashii.obscura最先从此亚属中分化出来,紧接着是montium种亚组.
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