目前大部分河流生态系统均受到人类活动的负面影响,全面推进河流生态恢复迫在眉睫,而量化评价河流生态系统健康状况对于科学引导河流生态恢复具有重要意义。生物多样性是河流健康的重要体现,保护关键功能组是提升生物多样性有效举措,对于改善河流生态系统健康十分重要。本论文以研究生态系统结构与功能常用的Ecopath模型为主要研究工具,探索了基于生态系统关键功能组筛选的河流生态健康评价方法优化技术路线。为完善中小河流生态健康评价相对较少的不足,本研究选取典型中小河流——清潩河（许昌段）进行应用验证,并结合最终评价结果提出了研究区域河流生态恢复建议,以期对同类型河流生态系统功能的恢复和提升提供依据。主要研究内容及结论如下:（1）基于水生生物调查结果,构建清潩河夏、秋季食物网模型。分别于2021年7月、10月开展清潩河水生态系统调查,共设置10个调查点位,分别获取水文、水质、生境及水生生物数据。基于生物调查,进一步计算并查阅文献确定模型参数,构建了不同季节的清潩河Ecopath食物网模型。模型模拟结果表明清潩河夏、秋季的食物网由牧食食物链和碎屑食物链组成,且大多以浮游植物和碎屑开始。生态系统总体特征参数显示,清潩河夏、秋季生态系统输出量、总呼吸量、总消耗量和流入碎屑总量的流量之和分别为2571.06 t/km~2和1472.58 t/km~2,夏季生态系统规模大于秋季;进一步分析生态系统成熟度指标发现,夏季Finn循环指数和Finn平均路径长度为秋季的2.15倍和1.33倍,夏季生态系统的成熟度高于秋季,但总体较于自然河流仍处于较低水平。（2）开展清潩河夏、秋季生态系统结构与功能分析,同时筛选关键功能组。从生态系统结构来看,清潩河夏、秋季生态系统营养级分布及鱼类生态位特征较一致,营养级分布范围均为1.00～3.29,生态位重叠现象主要发生在小型鱼类之间,上层和中下层小型鱼类生态位重叠程度最高,而肉食性鱼类无生态位重叠,捕食者和饵料重叠指数均接近于1,鱼类资源呈现小型化;从生态系统功能来看,夏、秋季生态系统总转化效率都很低,分别为1.08%、1.82%,明显低于生态系统9.2%的平均传输效率;依据物种的关键性指数,量化物种对食物网能量流动的影响程度,基于初级生产者、底栖动物和鱼类不同功能组的物种关键性指数排序结果,筛选出清潩河夏、秋季的关键功能组均为浮游植物、软体动物和翘嘴鲌。通过对关键功能组与环境因子进行典范对应分析（P＜0.05）,识别出河流夏、秋季影响关键功能组的主要环境因子为氮,其中翘嘴鲌的分布主要受NH4+-N影响,软体动物分布主要受NO3--N影响,浮游植物分布主要受NH4+-N和NO3--N的共同影响。（3）优化现有河流生态系统健康评价方法,根据失分项提出生态恢复建议。以《流域生态健康评估技术指南》中水域健康评价为基础,结合清潩河关键功能组筛选结果,对生物准则层评价指标进行优化,并采用组合赋权方法优化各指标权重,建立了适用于清潩河的“生境-关键功能组-压力”全方位健康评价标准体系。方法优化后健康评价结果变化明显,优化前清潩河整体夏、秋季健康状况分别为良好和较差,优化后为一般和较差,从不同河段健康评价结果来看,优化前清潩河干流、支流灞陵河和小泥河夏季评价结果分别为良好、一般和良好,秋季评价结果均为较差,优化后夏季评价结果分别为一般、较差和一般,秋季评价结果均为较差。对比健康评价方法体系的准则层得分发现,评价方法优化后秋季较夏季水生生物得分降低明显,而优化前得分不变,说明优化后的评价结果更能体现水生生物对外界条件变化响应,反映出的生态系统健康状况变化情况更为精准。最后兼顾关键功能组保护,以及不同河段健康评价主要失分项修复,提出控源截污和生境恢复、基于关键功能组的食物链恢复以及限制人为干扰等生态恢复建议。