SDPR在KRAS突变肺癌中的功能及潜在治疗价值的研究

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研究背景肺癌是最常见的恶性肿瘤之一,其死亡率在所有恶性肿瘤中位居第一。肺癌中,KRAS突变频率约占20%,KRAS因其功能结构域的特殊性及多样突变异构体的存在而缺乏特异性靶向药物,此外,肺癌常见的靶点基因大多位于KRAS上下游信号通路或其旁路,KRAS突变将异常激活其下游信号通路及其旁路从而介导多种靶向药物耐药。因此,KRAS突变肺癌治疗难度大、预后极差,寻找不依赖于KRAS信号通路且能够有效评估患者的预后及疗效的生物标记及潜在的治疗靶点尤显重要。方法构建基于Cre/loxp系统的KRASG12D突变转基因小鼠,利用Cre重组酶腺相关病毒定向启动KRASG12D突变基因的表达促进小鼠肺组织成瘤。通过分析GEO数据库中KRAS突变肺癌数据集的基因表达谱数据筛选差异表达基因SDPR,采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)、免疫组织化学染色(IHC)和western blot检测SDPR在人肺癌细胞系、肺腺癌组织芯片及KRAS突变转基因小鼠肿瘤组织标本中的表达的情况。此外,通过TCGA数据库、GEO数据库及GEPAI数据库分析非小细胞肺癌及KRAS突变亚群中SDPR的表达水平,采用Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析评价SDPR的预后价值;通过GSEA数据集及转录因子数据库预测SDPR可能结合的转录因子及miRNAs;利用GSEA数据集及TIMER在线网站分析SDPR、免疫检查点分子和肿瘤浸润模型之间的相关性。结果我们成功启动了KRASG12D突变基因在转基因小鼠模型中的表达,小鼠肺组织形成原发肿瘤。我们通过数据集筛选出SDPR是不同KRAS突变肺癌数据集中均下调的差异表达基因,同时,我们发现SDPR在KRAS突变肺癌细胞、转基因小鼠肺癌组织及人肺腺癌芯片组织中表达显著下调。生存分析及Cox回归分析提示SDPR低表达是肺癌尤KRAS突变亚群患者生存预后的独立预测因素。通过GEO数据集及网站分析预测DACH1、WT-1可能是SDPR上游的转录因子,miR-1、miR-204、miR-144、miR-106、miR-363 可能调控 SDPR的表达,DACH1及miR-1存在互补序列,依据此我们构建了 SDPR的ceRNA调控网络。此外,在非小细胞肺癌中,SDPR的表达水平与免疫检查点分子的表达(PD-L1、TNFRSF18、TNFRSF9、TDO2)呈负相关,不同SDPR的表达水平或拷贝数变异(CNV)肿瘤免疫浸润模式不尽相同。结论我们的研究发现SDPR在KRAS突变肺癌中显著下调,并在KRAS突变转基因小鼠中得以验证。此外,我们阐明了 SDPR在KRAS突变肺癌中潜在的调控网络,揭示了 SDPR表达水平与免疫浸润的关系,为KRAS突变非小细胞肺癌提供了一个独立的预后预测指标。我们探讨了 SDPR在KRAS突变肺癌中的预后价值、调控网络及免疫调节功能,后续还将深入探讨SDPR及其上下游信号通路是否参与了 KRAS突变介导的治疗抵抗并评估其能否为KRAS突变肺癌提供新的治疗方向。
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