在我国的知识产权法律体系中,若商标注册人将他人已在先享有著作权的作品作为商标加以注册并使用,那么就有可能涉及到注册商标侵犯他人在先著作权这一问题。自上世纪九十年代以来,以“‘武松打虎’商标案”为代表,我国注册商标侵犯他人在先著作权的案件愈来愈多。对于注册商标侵害他人在先著作权时停止侵害责任的限制问题,学术界曾广泛关注,但研究重点主要集中在具体案件的探讨以及总体思路和原则的研究,对如何具体地、合理地限制该种情形下停止侵害责任的适用,尚无比较全面和完整的研究成果。尽管我国《商标法》以及2009年最高人民法院出台的审判意见中曾对这一问题给予了回应,规定了以“五年”为时间标准的限制停止侵害责任适用的条件,但仍不尽合理和完善。全文除引言和结语外共有四个部分。第一部分梳理了注册商标侵犯他人在先著作权时停止侵害责任限制的相关概念和原则。该部分首先整理了关于注册商标侵犯他人在先著作权是否属于权利冲突的不同立场,本文认为这种情形并不构成权利冲突。紧接着,本文分析了停止侵害责任的内涵和性质,明晰了注册商标侵犯他人在先著作权时的停止侵害责任以及其限制的内涵,并分析了相比于普通的商标领域停止侵害责任的限制问题,注册商标侵犯他人在先著作权这一具体情形所独有的特殊性。最后本文分析了具体的的限制原则,为后文探索研究如何合理地对注册商标侵犯在先著作权停止侵害责任进行限制夯实了理论基础。第二部分从理论角度入手,提出了注册商标侵犯他人在先著作权停止侵害责任限制的必要性。首先基于利益平衡的视角,又分为在先著作权人与注册商标权利人之间的利益平衡、社会公共利益与个人利益之间的平衡这两个层次;其次是基于禁止权力滥用原则的视角,在先著作权人要求商标注册人承担停止侵害责任时极易导致权利滥用现象的发生,因此,应当在一定的条件下限制商标注册人承担的停止侵害责任;最后是基于经济学分析的视角,本文从社会成本、市场经济效益两个方面加以分析,论证了对停止侵害责任加以限制的合理性。第三部分归纳总结了目前关于停止侵害责任限制问题的各种立法模式。主要包括了以美国为代表的禁令体系对停止侵害责任的限制模式、以德国和日本为主的请求权体系中的对于停止侵害责任的限制模式,最后对不同的立法模式加以对比和分析,从而对我国相关制度的重构提供借鉴和启示意义。第四部分中,本文先总结了当前我国注册商标侵犯他人在先著作权案件中停止侵害责任的适用和限制的现状和存在问题,并在此基础上提出了完善我国注册商标侵犯在先著作权的停止侵害的限制制度的建议:在限制商标注册人的停止侵害责任时,应当充分考虑当事人的主观过错、双方损失以及社会公共利益这三方面因素,并且根据不同的案件具体类型来确定停止侵害责任限制适用的条件。但是,对停止侵害责任的限制毕竟是对商标注册人和使用人的倾斜性保护,为实现各方利益的平衡,还需要明确限制后的替代性措施——赔礼道歉和经济补偿,从而更加全面地实现对在先著作权人合法利益的保护。