当今知识时代,单个组织进行创新已明显处于劣势,取而代之的是组织之间通过建立知识联盟进行协同创新。知识联盟组织间知识、信息和资源的流动与互补,增强了联盟组织知识资源的获取能力和运用能力。借助知识联盟,组织可以更加容易地获取创新资源,在提高创新能力的同时,提高了组织的创新绩效。基于以上背景,本文确定了研究协同创新的主题,并试图从动态的、系统的角度出发,运用系统动力学方法建立协同创新系统动力学模型,并进行仿真分析。首先,进行系统描述与系统分析,并在此基础上确定系统边界和提出建模的条件假设。协同创新系统是一个动态的、复杂的创新组织方式,是一个融合了环境、资源、创新主体和市场的多元化系统。因此,本文确定研究联盟环境要素、资源要素、主体行为要素与效益要素对协同创新活动的影响过程,并据此提出七条假设：即知识联盟协同创新系统的运行过程是一个平稳无跳跃的连续过程；在整个系统运行的过程中,没有遭受到恶劣的外部环境引起系统崩溃的情况出现；创新协同效应可以用年创新成果数、年总产值等变量来衡量；除环境、资源、主体行为及效益要素外,其他因素对系统影响可忽略不计；假设不同的联盟类型对系统行为的影响忽略不计；知识资源与技术资源分别表示软性和硬性资源；创新成果产值近似等于年总产值,其他产值忽略不计。其次,在对协同创新实际系统进行深刻研究的基础上以及根据上述提出的影响协同创新的四个要素,确定了知识联盟协同创新的四个子系统,即联盟环境子系统、协同创新资源子系统、创新主体行为子系统以及协同创新效益子系统。根据每个子系统的特征,确定了描述各个子系统的变量,并建立了因果关系回路。然后,将四个子系统进行了汇总,确定了协同创新系统因果关系回路图。由于需要进行定量分析,本文还建立了协同创新系统流程图,确定了主要的系统动力学方程,为论文的仿真模拟打好了基础。最后,在以PNMS (Philips and Neusoft Medical Systems)的协同创新系统为背景搜集相关数据的基础上,进行了参数设置,确定了各参数值,并运用四种模型测试方法测试了模型的有效性。五种模型测试方法分别是边界适当性测试、结构评价测试、积分误差测试、极端情况测试以及参数灵敏度测试,测试结果显示所建的协同创新系统动力学模型有效。此外,还运用该模型对PNMS协同创新系统进行了综合仿真,并根据仿真结果给出了政策建议。通过仿真研究分析,证实了知识联盟协同创新问题是一个典型的系统动力学问题,系统内部各要素之间具有复杂的相互联系,每一个要素的变动都对创新协同效应的获得具有重大的影响。