作为农村经济发展的主要力量,农业合作社是主要服务于“三农”(农业、农村、农民)的,其经营状况的好坏,一方面在微观层面影响到合作社本身的发展壮大和市场竞争能力的高低,另一方面在宏观层面也制约着农村各种资源的有效配置和农村经济的稳步增长,也就是说,农业合作社的有效运行直接关系到中国农村经济的发展以及整个农村的稳定。而科学有效的法人治理结构是影响农业合作社经营状况好坏与否的一个至关重要的因素。科学、完善的法人治理结构不仅可以帮助农业合作社摆脱效率不高、经营业绩不佳的困境,同时也可以提高农业合作社的竞争力,去更好的应对日益激烈的市场竞争。法人治理结构从根本上说属于企业的经营制度范畴。基于刚刚颁布的《农民专业合作社法》对于农业合作社法人地位的充分肯定,以及目前现在国内正在进行的农业合作社改革与发展的需要,有必要在立足于我国实际情况的基础上,充分借鉴国内和国外关于企业法人治理结构的先进经验,明确建立农业合作社法人治理结构的基本思路。本文从一个普通的农业合作社入手,立足于该合作社的实际情况及我国农业合作经济发展的大背景,在仔细分析了农业合作社法人治理结构的内涵和外延,充分了解了农业合作社法人治理结构基本模式的基础上,找出了我国农业合作社法人治理结构的缺陷,针对这些农业合作社所共有的缺陷,从法律的角度提出了建立和完善我国农业合作社法人治理结构的一些可行性的建议,希望这些建议能为我国农业合作社的发展起到一定的促进作用。本文在充分借鉴《公司法》和《中华人民共和国农民专业合作社法》的基础之上,同时积极学习国内外关于法人治理结构理论研究的先进经验,从如何明确农业合作社中的产权关系,如何改善以及最大限度的发挥农业合作社中的社员大会、理事会、监事会的作用,如何在农业合作社中更好地进行股权设置等几个方面入手,从宏观和微观两个层面详细剖析了我国农业合作社法人治理结构的现状以及如何改革和完善我国农业合作社的法人治理结构。