作为农村金融体系中的主力军，农村信用社在其发展历程中，管理体制几经变革，改革工作也不断推进，虽然取得了明显的成效，但产权不明晰、管理体制不顺等深层次问题并没有得到根本解决。经营管理上的不善，造成了农村信用社资产状况不佳，历史包袱沉重，潜在风险十分突出。随着金融业改革的不断深入和当前农村经济发展的迫切需要，农村信用社的进一步系统性改革迫在眉睫。本文首先回顾了合作经济思想及其实践，比较了合作金融、股份金融和政策性金融的关系，接着通过对我国农村信用社的发展历程、经营现状、存在问题的阐述，深入剖析了制约农村信用社发展的原因。造成这些问题的原因包括内部和外部两个方面：内部原因主要是产权不清晰、法人治理结构缺损、行业管理体制混乱等；外部因素主要有行政干预较为严重、金融法规和配套改革的缺陷、社会信用环境不佳等。在此分析的基础上，借鉴国外合作金融发展的实践，本文提出了农村信用社系统性改革的思路和对策。我们认为，我国农村信用社改革是一项系统工程，应以服务农业、农村和农民为宗旨，从内部要求和外部环境两方面进行综合改革。