极端生存环境使深海热液区微生物具有十分独特的生理生化特征和能量代谢途径，这些微生物不仅是巨大的新型功能基因和新型生物活性物质资源库，同时也对深海生物地球化学过程有着巨大的影响，因此对深海热液微生物的研究十分必要。本文的第一部分对来自冲绳海槽热液区的一株细菌Exiguobacterium sp.HVEsp1进行了研究。HVEsp1分离自冲绳海槽深海热液沉积物，能在50℃生长，游动能力强，具有多种重金属和抗生素抗性。HVEsp1的基因组大小为2838499 bp，G+C含量为48.2％，包含2948个编码序列。基因组序列分析显示了大量与细胞运动、重金属抗性、抗生素抗性和耐热相关基因。通过与其亲缘关系最近的菌株Exiguobacterium sp.AT1b进行比较基因组分析发现，HVEsp1的基因组中移动元件数量丰富，它们可能在细菌通过基因水平转移获得有利基因的过程中发挥重要作用。这些结果加深了我们对深海热液细菌适应极端环境机制的了解，也为以后的深入研究奠定了基础。　　在本文第二部分中，我们从分离自热液沉积物和大型生物样品的细菌中筛选了出一株致病菌株Bacillus sp.SR-52。分析发现，SR-52对大菱鲆和小鼠有较高致死率。进一步研究发现SR-52在大菱鲆血清和小鼠血清中具高存活率，与SR-52孵育后的大菱鲆血清溶血活性和杀菌活性均显著降低，说明SR-52能激活宿主血清中的补体系统，同时也能够抵抗补体的杀伤作用。大菱鲆体内感染实验表明，SR-52能侵入肝、脾和肾，且随感染时间延长组织中细菌数量增加，说明细菌能在宿主组织内繁殖。这些研究结果为深海致病菌的致病机制的深入研究奠定了基础。