不同来源肠道金黄色葡萄球菌的流行病学研究

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金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus,S.aureus)是一种重要的人兽共患病原菌,它可以引起肺炎、心包炎,甚至败血症、脓毒症等全身感染性疾病。由于目前对金黄色葡萄球菌感染尚无有效的疫苗,因此合理的抗生素治疗是防治金黄色葡萄球菌感染的主要手段。自20世纪30年代以来,医务工作者在临床治疗细菌感染中对抗生素的过度依赖,导致细菌耐药性的问题日趋严重,甚至诞生了耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)。有研究报告显示,MSSA(Methicillin-sensitive Staphylococcu aureus,甲氧西林敏感型金黄色葡萄球菌)和MRSA的定植不仅局限在鼻腔、皮肤,同时也可以发生在肠道中。MRSA不仅可以在单一物种的不同个体间传播,也可以在人和动物之间发生交叉传播。此外,MRSA的传播途径也变得更加多样化:不仅发生在养殖场、屠宰场、医院、社区,也发生在零售市场以及相关的周围环境中。本研究对来自养殖场不同动物的粪便或肛拭样、屠宰场及其周围环境的擦拭样、医院患者的肛拭样,共计4054份样品进行了菌株分离鉴定。分离金黄色葡萄球菌共计410株:粪便或肛拭样共计2932份样品,分离菌株有342株;屠宰环节及其周围环境的擦拭样共计1122份样品,分离的菌株有68株。我们对其进行了药物敏感性试验、最小抑菌浓度(MIC)试验以及分子遗传特征研究。本研究对采集的试验样品进行增菌、纯化、培养,随后利用培养基的显色特征、金黄色葡萄球菌特有的nuc基因(耐热核酸酶基因)、导致耐苯唑西林或甲氧西林抗生素的mecA基因(编码产生青霉素结合蛋白PBP2)对疑似菌株进行MRSA与MSSA的鉴定。结果显示:肠道携带的金黄色葡萄球菌分离株共有342株(11.6%):猪源66株、鸡源90株、牛源94株、野生动物源6株、人源91株。屠宰场及其周围环境的金黄色葡萄球菌分离株共有68株:猪源39株、鸡源26株、牛源1株、野生动物源2株。本研究对从肠道分离的342株金黄色葡萄球菌进行纸片法-药敏试验以及MIC试验,菌株对14种抗生素的耐药率由高到低依次是:氨曲南(99.1%)、青霉素(76.7%)、红霉素(50.4%)、四环素(47.2%)、环丙沙星(38.1%)、卡那霉素(36.4%)、克林霉素(36.1%)、庆大霉素(31.2%)、氯霉素(29.7%)、头孢西丁(28.2%)、磺胺甲恶唑(12.8%),其中利福平、利奈唑胺、呋喃妥因的耐药率均为0;MIC试验结果表明,除了 2株(3%)猪源分离菌株对万古霉素耐药之外,其余的菌株均表现为敏感,即没有出现MIC>2μg/mL的现象,但是多数菌株存在中介耐药的情况;同时,我们对屠宰环节及其周围环境的金黄色葡萄球菌也进行了药敏试验以及MIC试验,对14种抗生素的耐药率由高到低依次是:氨曲南(100%)、青霉素(64.7%)、四环素(63.2)、红霉素(51.2%)、克林霉素(42.6%)、环丙沙星(41.1%)、卡那霉素(29.4%)、氯霉素(20.6%)、呋喃妥因(5.9%)、头孢西丁(4.4%)、磺胺甲恶唑(2.9%)、庆大霉素(1.5%),其中利福平与利奈唑胺的耐药率为0;MIC试验显示所有菌株对万古霉素敏感,没有出现MIC>2 μg/ml的菌株。对人源MRSA菌株携带的16种耐药基因spc、aadD、aph(3)-Ⅲ、aac(6’)-aph(2")、blaZ、mecA、norA、dfrG、tetK、erm(A)、erm(B)、erm(C)、vga(E)、msr(A)、msr(C)、lnu(A)进行分析,结果表明所有的菌株都具有多重耐药性,这些菌株对喹诺酮类药物都具有耐药性,其中耐药最严重的是来自某一医院的人源菌株,属于克隆复合体CC5家族,且为spa型最常见的t002。本研究对猪源、鸡源、牛源、野生动物源以及人源的金黄色葡萄球菌菌株进行spa分型。105株猪源菌株共有10种spa类型,其中t2970为优势spa型,占28.2%。116株鸡源菌株共有6种spa类型,其中t899为优势spa型,占77.1%。95株牛源菌株共有13种spa类型,其中t2734为优势spa型,占54.3%。6株野生动物源共有5种,其中t377和t034为优势spa型,各占25%。91株人源菌株spa类型最多且最复杂,共有40种spa类型,其中t002为优势spa型,占14.3%;44株MRSA菌株可分为14个ST型,表明金黄色葡萄球菌在遗传进化过程中具有遗传多样性。其中人源MRSA菌株的ST型最多且最复杂,占所有ST型的77.3%。动物源MRSA菌株的ST类型比较单一,占所有ST型的22.7%。;44株MRSA菌株可分为10个CC型(cloning complex,克隆复合体),人源MRSA菌株的CC型最为复杂,其中CC1最多,达到18.2%。动物源MRSA菌株的CC型比较单一,CC398占比最多,为20.5%。在所有的MRSA菌株中,CC5主要存在于医院相关MRSA(HA-MRSA)中,而CC398主要存在家畜相关MRSA(CA-MRSA)菌株中,而人源菌株的CC398(t011与t1451)也存在于动物源菌株中,表明MRSA在人与动物之间的传播可能性。此外,CC5仍是我国人源菌株的优势克隆群,且为多重耐药最严重的克隆群。
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