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拟南芥miR396家族由miR396a和miR396b两个成员组成，分别由两个不同的基因MIR396a和MIR396b编码。GRF(growth-regulatingfactors)家族的七个成员和一个bHLH(basicHelix-Loop-Helix)转录因子bHLH74是miR396作用的靶基因。miR396-靶基因模块通过调控细胞增殖，在拟南芥叶发育中发挥重要作用。
为了探索miR396在拟南芥根生长发育中的功能，揭示MIR396基因家族不同成员功能差异性的原因，我们进行了MIR396及其靶基因bHLH74的表达分析，研究了miRNA及靶基因功能缺陷突变体拟南芥的根发育表型，获得的主要结果如下:
1.mir396a-1突变体的筛选和表型观察经两轮PCR筛选获得纯合的mir396a-1突变体之后，qRT-PCR检测表明突变体中MIR396a前体和miR396成熟体的表达量均下降。通过表型观察发现，mir396a-1突变体的根长明显高于野生型，这与35S∶MIR396a转基因株系表现为短根表型刚好相反，由此推断miR396a在拟南芥根生长发育过程中发挥一定的作用。
2.靶基因bHLH74在拟南芥根生长调控中的作用对启动子报告株系probHLH74∶GUS的拟南芥幼苗进行GUS组织染色观察，结果表明靶基因在叶片以及根部都有表达，其主要分布于主根的维管束和新生侧根。
通过同义突变bHLH74基因中miR396的结合位点，构建了35S∶mbHLH74转基因拟南芥株系，通过qRT-PCR检测获得bHLH74表达量升高的转基因株系。通过与bhlh74-1突变体进行表型观察对比发现，35S∶mbHLH74拟南芥表现为根长高于野生型，而bhlh74-1的主根长度短于野生型。进而对野生型、35S∶mbHLH74转基因株系和bhlh74-1突变体进行根部细胞的观察和统计分析，结果表明miR396是通过介导bHLH74的抑制对根部分生区的细胞增殖进行负调控来影响根的生长发育。
3.MIR396a和MIR396b前体产生的sRNA分析通过对35S∶MIR396a和35S∶MIR396b转基因拟南芥进行smallRNA测序分析，并将测序结果与野生型拟南芥数据比对分析，结果表明在35S∶MIR396a和35S∶MIR396b转基因拟南芥中分别形成了不同的次生sRNA以及miRNA的变异体。烟草注射的瞬时转化实验结果显示不同的sRNA对靶基因的抑制效率不同。此外，MIR396不同基因座的过表达还影响多个其它miRNA的表达，这些可能都是造成35S∶MIR396a和35S∶MIR396b转基因拟南芥根部表型差异的原因。