甜瓜遗传图谱构建及果实和种子相关性状OTL定位

来源 :河南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zc198926
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甜瓜是世界十大水果之一,果实是甜瓜的食用器官。因此甜瓜果实相关农艺性状的遗传改良一直是育种家们共同关注的目标。甜瓜具有广泛的表型与遗传多样性,不同材料之间的果实和种子差异很大如大小、颜色和形状等。利用不同的材料配置作图群体,构建高密度遗传图谱并对果实与种子相关性状进行QTL定位,挖掘控制果实和种子相关性状的优异基因,不仅有利于解析其遗传基础与调控网络,而且也将为遗传改良与分子育种打下坚实的基础。本研究选择果实等表型差异较大的自交系DHL92和M323为亲本构建F2群体,进行遗传图谱的构建,并结合田间表型对甜瓜果实和种子相关性状进行QTL分析,具体结果如下:1.通过对甜瓜单果重、硬度、含糖量、果长、果宽、果形指数、果肉厚、种子长度、种形指数、种宽和千粒重等1 1个重要农艺性状的统计学分析,发现F1代群体在单果重、果长、果实硬度、千粒重、种子长和种子宽等性状的均值处于两亲本之间,而果宽、果形指数、果肉厚、可溶性固形物和种形指数等性状出现超亲优势。对这些性状进行相关性分析,发现单果重、果长、果宽和果肉厚四者两两之间呈现极显著性相关;果形指数和果长、果宽都呈现极显著性相关;种子长、种子宽和千粒重三者之间两两呈极显著性相关;种形指数与种长呈极显著性相关。田间性状调查的结果显示所有性状皆符合正态分布,属于典型的数量性状。2.在1400个SSR标记中筛选出多态性较好的283个标记,对93个F2单株进行基因型分型,得到了一张共含有283个SSR标记和12条连锁群的遗传图谱,该图谱总长996 cM,标记间平均距离为3.52 cM;其中,LGXI连锁群上含有最多标记数目,为62个;LGI连锁群标记数目最少,仅有1 1个;LGIV连锁群长度最长,为124 cM;LGVIII连锁群长度最短,为32.76 cM。该图谱与甜瓜物理图谱的共线性分析显示明共有9条连锁群的拟合程度大于0.8,表明本研究所构建图谱质量较高。3.对甜瓜果实相关性状进行QTL分析,共检测到16个QTL位点。其中,与单果重(fw5.1)、果长(fl2.1)、果肉厚(ft5.1)和可溶性固形物(ssc7.1)相关的QTL位点均有1个,分别位于LGV、LGII、LGV和LGVII连锁群上,贡献率分别达到3.11%、3.73%、5.54%和5.51%;与果形指数(fsi10.1、fsi12.1)相关的位点有2个,分别位于LGX和LGXII连锁群上;LGX连锁群上位点的LOD值为6.76,可解释的表型变异为17.77%,该位点侧翼标记为CmSSR23531和CmSSR23609,两标记间遗传距离为8.19 cM。与果宽(fd5.1、fd 7.1、fd9.1、fd11.1)相关的QTL位点共检测到4个,分别位于LGV、LGVII、LGIX和LGXI连锁群上;其中,LGVII连锁群上的贡献率最高,为10.79%,此位点在(CmSSR17170标记附近。与硬度相关(fh1.1、Jh2.1、fh2.2、fh8.1、fh10.1、fh12.1)的QTL位点共有6个,分别位于LGI、LGII、LGII、LGVIII、LGX和LGXII连锁群上;其中,LGVIII连锁群上位点的LOD值和贡献率最大,分别是13.31%和16.18%。4.对甜瓜种子相关性状进行QTL分析发现与种子宽(sd3.1)和种形指数(ssi4.1)相关的QTL位点均有一个,分别在第LGIII和LGIV连锁群上,可分别解释的表型变异为3.37%和 5.24%。
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