传统发酵乳制品中蕴含着丰富的微生物资源,是近年来乳品研究领域的热点。全面、深入、客观的研究发酵乳制品中的微生物多样性对于产品的品质改良和工业化生产具有重要意义。我国近年来关于传统发酵乳中微生物研究多数研究都是基于实验室纯培养方法的,但传统纯培养方法研究微生物多样性具有局限性。因此,本研究通过焦磷酸测序技术对采集自我国新疆地区昭苏县和特克斯县的22份传统发酵乳制品中的微生物多样性进行研究,旨在深入了解昭苏县和特克斯县发酵乳制品中细菌及真菌的生物多样性和群落结构,阐明地域对微生物群落结构差异的影响。本论文的研究结果表明：来自新疆地区昭苏县和特克斯县的22份酸牛奶样品中,共检测到属于细菌的6个菌门,69个属和真菌的2个菌门,20个属。在本论文的昭苏县和特克斯县酸牛奶样品中,硬壁菌门(Firmicutes,97.33%)是细菌中的优势菌门,子囊菌门(Ascomycota,99.83%)是真菌中的优势菌门。在属水平上,22份酸牛奶样品中,乳杆菌属(Lactobacillus,77.94%)是昭苏县和特克斯县样品中的细菌优势菌属,酿酒酵母属(Saccharomyces,40.43%)是真菌优势菌属(40.43%)。本论文研究结果表明,新疆昭苏县酸牛奶样品中细菌多样性高于特克斯县样品中细菌多样性(平均Shannon指数分别为1.65±0.65、1.53±0.63),而真菌多样性低于特克斯县样品中的真菌多样性(平均Shannon指数分别为0.52±0.47、1.95±0.87)。而昭苏县样品的细菌序列丰度和真菌序列丰度(平均Chao 1指数分别为78.66±28.29、34.42±11.56)均低于特克斯县样品中的细菌、真菌序列丰度(平均Chao 1指数分别为90.88±32.64、51.72±19.33)。新疆昭苏县和特克斯县地区样品中,细菌群落结构及真菌群落结构均差异不显著,这也表明在本论文中地理区域对发酵乳中微生物群落结构影响不大。