并购已逐渐成为企业发展壮大所采取的最主要方式之一，但非常不幸的是：我国国内市场企业并购的成功率低于50%，而我国企业跨国并购的成功率不足30%，这一点从近几年企业并购的实际情况看尤其如此。这主要是由两个方面的原因造成的：1、从实践上来说，参与并购的企业更多的关注于并购的谈判和交易，而对在更大程度上左右着并购成败及企业战略成败的并购后整合和资源重组问题则不大关注，而结果往往导致并购后控制乏力，浪费投入资源；2、从理论上来说，尽管当前有很多学者开始关注并购问题，但很多研究仍不够深入，多层次的研究仍缺乏。由于缺乏合理的理论指导，人们对并购、并购后整合与重组及实现协同效应的内在逻辑缺乏深刻的理解和把握。尤其是面对激烈竞争的当今世界，企业如何在横向并购中通过供应链间的整合获得协同效应，已逐渐成为企业并购中最棘手的问题之一。因此，正是基于此本文以横向并购后供应链网络（Supply Chain Network,以下简称SCN）的优化整合为研究对象，具有强烈的时代背景和极大的应用价值，为企业实现并购后协同效应的最大化提供了时间借鉴以及理论根据，对企业并购后战略目标的实现具有极其重大的意义。正是基于上述思路，本文从并购中的供应链角度，以获得并购后的协同效应为主线，研究企业并购前供应链间的博弈问题、企业横向并购后的SCN特征、企业横向并购的实质和动因以及企业并购后SCN的最优运作整合问题，着重研究了：针对不确定情况下供应链的最优运作整合问题，对供应链间各成员的博弈进行了详细分析；对不确定情况下并购后的SCN优化整合进行研究；针对需求不确定情况下并购后的SCN整合进行研究；作为实践应用，应用本文提出的理论对制造企业东北特钢集团资产重组后的生产流程整合问题进行了研究。本文工作不仅在SCN管理领域中具有重要的现实意义和理论价值，而且对现实世界的并购整合问题具有极其重要的指导价值，主要工作和成果包括以下的几个方面：在比较了横向并购与纵向并购的动因与特征的基础上，对企业横向并购的优势进行了提炼，明确了横向并购后的资源均衡特征，理论分析了供应链网络的内涵及其协同效应，从随机博弈出发构建了SCN的随机均衡模型，对得到随机博弈均衡的前提条件进行了详细分析。对于得到的随机均衡模型，本文将内点方法和拟蒙特卡罗相结合提出了一类新的算法进行求解，对于所提出的算法本文不仅给出了新方法的全局收敛性证明，还对新方法进行了相应的数值试验。对企业横向并购后的SCN(假设含有生产资源和营销资源)最优运作整合进行分析，由于考虑到是横向并购，因此不失一般性，本文所有章节均考虑只有一种商品参与供应链的流通的情形。首先，对横向并购后的SCN特征和横向并购的实质和动因进行了分析；其次，利用系统分析的方法对非并购企业的SCN作为一个整体进行了详细分析；最后，利用系统分析的方法，对横向并购后企业的SCN进行了研究，分别对并购后营销资源整合、生产资源整合和双资源整合(即营销资源和生产资源整合)详细分析，分别构建了相应的随机均衡模型。为验证上面理论的可行性，本文利用并购绩效评价模型对横向并购后SCN的最优运作整合进行了仿真分析，结果显示了本文方法的有效性。进一步对企业横向并购后含有生产资源和营销资源的SCN进行分析，在需求不确定的情况下，构建了并购后SCN的鲁棒优化模型。首先，对市场的不确定性质和针对不确定性优化方法选择进行了详细分析，指出鲁棒优化方法在分析不确定性问题方面的优越性；其次，对需求不确定情况下非并购企业SCN进行研究，利用系统分析方法分别构建了需求在满足箱约束、多项式约束和椭圆约束三种情况下的鲁棒优化模型，得到了相应非并购SCN的最优运作策略；最后，对需求不确定情况下横向并购后的SCN进行研究，提出横向并购后SCN的最优整合策略，并利用数值试验验证了方法的有效性。作为研究成的应用，分别利用随机博弈理论和鲁棒优化方法，讨论制造企业东北特钢集团资产重组后生产流程整合问题，通过计算提出企业横向并购后随机均衡运作的生产线资源共享对策，以及需求不确定企业横向并购后SCN运作整合的营销资源共享对策。