基于非编码RNA的胃癌标志物筛选鉴定研究

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背景:胃癌是世界上第四大肿瘤,其致死人数占所有肿瘤死亡人数的第二位。随着科技的发展,胃癌的治疗水平有所提高,但胃癌的中位生存期仍然不足1年。胃癌的主要致死原因是肿瘤的侵袭和转移。长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA。环状RNA(circRNA)通过反向剪切的方式形成一类非编码RNA,它们没有5’帽子结构及3’端的Poly A结构,以共价键形成环状。已有研究发现长链非编码RNA及环状RNA在肿瘤的增殖、侵袭、转移方面发挥重要作用。LncRNA及环状RNA的调节紊乱导致了多种肿瘤的发生。胃癌的早期诊断是胃癌治疗及预后的关键。循环核酸可以用于胃癌的诊断及预后,也可以作为治疗的靶标及潜在的标志物。方法:通过查阅文献及数据库分析,选择14个lncRNA及50个肿瘤热点基因对应的circRNA,设计并验证引物。收集66对胃癌组织及癌旁组织,通过荧光定量PCR的方法检测了它们在胃癌组织及癌旁组织的表达;检测目的非编码RNA在77对胃癌患者术前和术后血浆及60例体检正常人血浆中的表达水平,并确认目标lncRNA、circRNA的诊断效率;挑选有意义的lncRNA,验证它们在细胞水平的表达;通过EpCAM磁珠把胃癌细胞分为高表达EpCAM部分及低表达EpCAM部分,鉴定目标lncRNA与EMT相关分子的相关性:通过TGF-β1的诱导肿瘤细胞形成EMT模型,检验细胞EMT后lncRNA及EMT相关标志物的变化;最后通过siRNA干扰实验、划痕实验、CCK8增殖实验/及平板克隆形成实验验证lncRNA与胃癌侵袭转移的相关性。结果:LncRNA ZFAS1在66例胃癌组织中表达高于癌旁组织,且与肿瘤大小及侵袭有关;术前患者血浆中ZFAS1的水平高于术后正常人,且与肿瘤大小、侵袭及转移相关;细胞学实验显示ZFAS1在肿瘤细胞中的表达水平高于正常胃黏膜细胞;通过基于EpCAM的细胞分选后,上清中ZFAS1的表达水平高于捕获细胞,且与EMT相关的间质化分子成正比;通过TGF-β1诱导SGC-7901细胞建立EMT模型,完成诱导后,间质化标志物ZEB1及Snail表达升高,而上皮性标志物CDH1及EpCAM表达降低,而ZFAS1表达水平同步升高;进一步,为研究ZFAS1与细胞侵袭转移的相关性,利用SGC-7901细胞进行了RNAi实验,干扰ZFAS1的表达后,间质化标志物ZEB1及Twist表达降低:划痕实验、Transwell迁移实验及平板克隆形成实验的结果显示,ZFAS1干扰后,SGC-7901细胞迁移能力降低,克隆形成能力也降低,进一步表明ZFAS1可能与肿瘤细胞的侵袭迁移能力有关。在胃癌组织中,C ircRNA-Smarca5的表达低于癌旁组织:而在血浆中,其表达水平与体检正常人没有差别;但胃癌患者手术后2周血浆CircRNA-Smarca5的水平降低了30%,提示CircRNA-Smarca5可以作为一种胃癌预后的标志物。结论:ZFAS1可以作为一种胃癌标志物,反映胃癌肿瘤大小及转移,并可以作为一种间质化的标志物;ZFAS1通过调节EMT的过程影响肿瘤的侵袭转移能力;CircRNA-Smarca5可以作为一种诊断及预后标志物。
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